131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0036 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  100 
 
 		 207 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  49.75 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  39.49 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  36.49 
 
 		 231 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  36.49 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  39.22 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  39.7 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  34.56 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  33.65 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  33.16 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  32.13 
 
 		 229 aa  101  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  33.18 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  33.18 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  33.18 
 
 		 225 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  33.04 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  35.96 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  34.5 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  32.24 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  34.74 
 
 		 228 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  34.96 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  33.94 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  32.24 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  34.23 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  35.71 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  35.71 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  35.2 
 
 		 252 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  30.41 
 
 		 225 aa  92  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  33.5 
 
 		 232 aa  91.7  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  33.48 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  34.38 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  33.17 
 
 		 226 aa  89  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  31.22 
 
 		 229 aa  87.8  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  32.86 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  34.62 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  35.15 
 
 		 240 aa  85.5  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  33.18 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  30.05 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  29.84 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  23.12 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  35.94 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  30.37 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  22.83 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  22.28 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  32.2 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  32.2 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  27.48 
 
 		 451 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0896  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.66 
 
 		 239 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  28.93 
 
 		 457 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  31.36 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  31.36 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  28.93 
 
 		 457 aa  51.6  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  31.15 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  30.51 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.5 
 
 		 453 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.62 
 
 		 480 aa  48.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  25.95 
 
 		 453 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  25.95 
 
 		 453 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  30.51 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  26.27 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  28.81 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  26.23 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  28.81 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  32.28 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  30.51 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  28.33 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  26.23 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3180  DnaA regulatory inactivator Hda  32.06 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  30.51 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  24.03 
 
 		 464 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  29.66 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  29.27 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  23.08 
 
 		 570 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0443  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.12 
 
 		 487 aa  45.8  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.39 
 
 		 453 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.49 
 
 		 515 aa  45.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.23 
 
 		 454 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0673  DnaA regulatory inactivator Hda  28.26 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.27 
 
 		 463 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  28.81 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.81 
 
 		 652 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  22.81 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  22.83 
 
 		 441 aa  44.3  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1967  DNA replication initiation factor  22.03 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187389  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  19.17 
 
 		 477 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.27 
 
 		 449 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  22.03 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  34.52 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  28.93 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.79 
 
 		 503 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  25 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  25 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2775  DnaA regulatory inactivator Hda  27.13 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00936325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1916  DNA replication initiation factor  24.24 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1763  chromosomal replication initiator, DnaA  27.91 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  25.76 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  25.76 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  25.76 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3022  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  27.78 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>