126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2552 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  100 
 
 		 233 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  41.44 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  42.79 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  41.67 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  42.48 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  42.34 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  38.5 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  40.34 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  40.38 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  40.36 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  35.78 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  35.78 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  35.93 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  37.67 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  40.18 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  40.95 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  39.91 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  40 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  36.56 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  40.27 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  36.61 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  40 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  37.89 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  37.33 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  36.89 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  38.91 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  39.74 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  39.01 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  39.46 
 
 		 255 aa  114  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  35.98 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  38.24 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  38.24 
 
 		 252 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  38.57 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  31.7 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  36.28 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  38.63 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  31.3 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  31.82 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  33.68 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  31.67 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  27.04 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  34.93 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  25.45 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  24.85 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.29 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  27.03 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  21 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  28.76 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3847  DnaA regulatory inactivator Hda  28.32 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  30.65 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  24.68 
 
 		 440 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  31.45 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0276  DnaA regulatory inactivator Hda  28.57 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0760  DnaA regulatory inactivator Hda  28.57 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0673  DnaA regulatory inactivator Hda  31.17 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  28.26 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  33.73 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  23.48 
 
 		 440 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  23.48 
 
 		 440 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0654  DnaA regulatory inactivator Hda  28.12 
 
 		 318 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0679  DnaA regulatory inactivator Hda  28.12 
 
 		 318 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  22.71 
 
 		 441 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  26.2 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  26.26 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  22.17 
 
 		 436 aa  49.3  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  23.61 
 
 		 477 aa  49.3  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  26.26 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  24.06 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  28.24 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1901  hypothetical protein  28.51 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.198388  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.23 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1576  DnaA regulatory inactivator Hda  28.51 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.298764  hitchhiker  0.00654895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  27.32 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2489  DnaA regulatory inactivator Hda  28 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  26.74 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12738  chromosomal replication initiation protein  20.66 
 
 		 475 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.843582  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2318  DnaA regulatory inactivator Hda  29.24 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1916  DNA replication initiation factor  27.75 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0509  DnaA regulatory inactivator Hda  29.24 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.679706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1090  DnaA regulatory inactivator Hda  29.24 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3269  DnaA regulatory inactivator Hda  29.24 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0915676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3302  DnaA regulatory inactivator Hda  29.24 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2197  DnaA regulatory inactivator Hda  29.24 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0005  chromosomal replication initiation protein  21.07 
 
 		 475 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  22.45 
 
 		 471 aa  45.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  23.47 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3180  DnaA regulatory inactivator Hda  31.03 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3312  DnaA regulatory inactivator Hda  29.24 
 
 		 332 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  27.32 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  27.17 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1316  DnaA regulatory inactivator Hda  29.24 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0581271  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  20.96 
 
 		 436 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2186  DnaA regulatory inactivator Hda  28.51 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2625  DnaA regulatory inactivator Hda  28.25 
 
 		 315 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0746  DnaA regulatory inactivator Hda  27.05 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.653326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.74 
 
 		 453 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  28.25 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  28.25 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2174  Chromosomal replication initiator DnaA  28.9 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>