133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1963 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  56.64 
 
 		 232 aa  251  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  56.39 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  56.39 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  50.89 
 
 		 240 aa  218  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  50.45 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  50.89 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  50.45 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  43.06 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  45.74 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  42.67 
 
 		 225 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  44.8 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  44.09 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  44.29 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  45.78 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  42.27 
 
 		 225 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  47.3 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  42.48 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  42.47 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  42.11 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  42.48 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  42.92 
 
 		 252 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  44.25 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  44.55 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  41.44 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  44.24 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  43.78 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  42.99 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  43.32 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  42.92 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  41.96 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  41.26 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  40.79 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  38.77 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  38.6 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  37.39 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  35.93 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  39.7 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  34.91 
 
 		 220 aa  98.2  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  28.64 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  34.01 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  28.72 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  28.64 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  32.58 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  36.68 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  29.75 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.52 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  32.29 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  29.69 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  29.02 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  29.91 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.13 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  29.54 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  29.54 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  28.1 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  28.1 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  28.11 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  32.69 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  28.82 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  28.42 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  28.42 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  27.62 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.07 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  24.89 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  24.89 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  24.89 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  29.29 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  28.87 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1763  chromosomal replication initiator, DnaA  26.61 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  28.87 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  26.56 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  28.94 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0896  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  23.53 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1838  DNA replication initiation factor  26.41 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0197732  normal  0.185347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  27.27 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1967  DNA replication initiation factor  26.44 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187389  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  25.75 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1071  chromosomal replication initiator, DnaA  26.15 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  28.63 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2877  DNA replication initiation factor  27.27 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  27.27 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  27.27 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  27.27 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1691  DNA replication initiation factor  27.27 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1916  DNA replication initiation factor  28.95 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.57 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  22.81 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2441  DNA replication initiation factor  26.2 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689375  normal  0.0202229 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02146  Chromosomal replication initiator, DnaA like protein to DnaA protein Hda  26.48 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2320  chromosomal replication initiator, DnaA  27.73 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107711  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1786  DNA replication initiation factor  26.74 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000114863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1779  DNA replication initiation factor  26.74 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000277265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1823  DNA replication initiation factor  26.74 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000711754  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2499  DNA replication initiation factor  26.74 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  26.46 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  25.11 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2454  DnaA regulatory inactivator Hda  28.21 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2860  DnaA regulatory inactivator Hda  28.21 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  23.74 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2616  DnaA regulatory inactivator Hda  25.97 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>