More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0001 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
445 aa  918    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  64.61 
 
 
441 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  65.17 
 
 
444 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.31 
 
 
446 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.59 
 
 
453 aa  528  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  57.14 
 
 
450 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  57.37 
 
 
450 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  57.24 
 
 
446 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  58.3 
 
 
442 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  57.37 
 
 
446 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  57.4 
 
 
446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  57.4 
 
 
446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  56.82 
 
 
446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  56.82 
 
 
446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  56.82 
 
 
446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  56.82 
 
 
446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  56.82 
 
 
446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  56.79 
 
 
446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  57.24 
 
 
446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  54.63 
 
 
457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  54.85 
 
 
457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  57.67 
 
 
443 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  56.92 
 
 
443 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.14 
 
 
449 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  54.57 
 
 
440 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.63 
 
 
463 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.98 
 
 
443 aa  485  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.8 
 
 
454 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  53.69 
 
 
436 aa  486  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  51.01 
 
 
451 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.87 
 
 
454 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  49.89 
 
 
453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  49.89 
 
 
453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  46.78 
 
 
449 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  47.3 
 
 
445 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.32 
 
 
453 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  48.3 
 
 
478 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.03 
 
 
439 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.76 
 
 
461 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  46.73 
 
 
450 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  46.55 
 
 
459 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.11 
 
 
439 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  44.08 
 
 
458 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  46.97 
 
 
472 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  43.67 
 
 
460 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  46.65 
 
 
452 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  48.58 
 
 
470 aa  411  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.97 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.73 
 
 
456 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  44.35 
 
 
481 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.53 
 
 
450 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  45.05 
 
 
480 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  47.22 
 
 
482 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.35 
 
 
587 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.08 
 
 
591 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  45.68 
 
 
460 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  45.88 
 
 
460 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.05 
 
 
447 aa  398  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  45.93 
 
 
453 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  45.93 
 
 
453 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.83 
 
 
473 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.83 
 
 
458 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  46.94 
 
 
453 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.67 
 
 
462 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  46.33 
 
 
456 aa  388  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  46.4 
 
 
464 aa  390  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.39 
 
 
509 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.94 
 
 
474 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.6 
 
 
506 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  43.94 
 
 
462 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.76 
 
 
527 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  43.7 
 
 
460 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  43.6 
 
 
461 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.26 
 
 
721 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  43.38 
 
 
461 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  43.94 
 
 
462 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  43.7 
 
 
460 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  43.7 
 
 
460 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.61 
 
 
464 aa  388  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  43.7 
 
 
460 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  43.64 
 
 
457 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  44.09 
 
 
465 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  45.54 
 
 
452 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  45.54 
 
 
452 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  44.09 
 
 
465 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
462 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  44.81 
 
 
463 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
462 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  43.17 
 
 
462 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
462 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  43.7 
 
 
461 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
462 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  42.79 
 
 
459 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  59.47 
 
 
582 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.11 
 
 
467 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  43.25 
 
 
467 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  43.04 
 
 
467 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  44.11 
 
 
467 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  53.5 
 
 
495 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  42.74 
 
 
492 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>