More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0000.1 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 445 aa  921    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  82.67 
 
 		 450 aa  778    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  69.71 
 
 		 449 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  63.95 
 
 		 458 aa  624  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  64.35 
 
 		 460 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  61.25 
 
 		 452 aa  551  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  57.08 
 
 		 459 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  55.33 
 
 		 450 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.11 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.06 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  49.77 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  49.77 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  49.77 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  49.77 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  49.77 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  47.75 
 
 		 450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  49.77 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  49.77 
 
 		 446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  48.67 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  49.44 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  49.44 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  48.42 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  48.86 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  48.44 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  48.75 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.53 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  49.21 
 
 		 442 aa  435  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  47.51 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  48.07 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.43 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  48.54 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.4 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.5 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.29 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.84 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.88 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  47.42 
 
 		 443 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  47.3 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  46.3 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.3 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  43.5 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  44.22 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  43.87 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.87 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  43.75 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  43.87 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  43.87 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  43.75 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  43.87 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  43.87 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  43.75 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  43.87 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  43.75 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  43.87 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  43.75 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.73 
 
 		 455 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  43.53 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  43.66 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  43.23 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  43.38 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  44.95 
 
 		 455 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  43.38 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  43.41 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  41.83 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.32 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  41.36 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  44.68 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  44.68 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  41.83 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  44.14 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.14 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.86 
 
 		 464 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  40.94 
 
 		 495 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  41.83 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  41.83 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.17 
 
 		 469 aa  392  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  41.36 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  41.36 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  41.36 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.26 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  41.96 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  41.18 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  41.18 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  41.52 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.42 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.64 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  41.18 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  41.27 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  41.05 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.65 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  42.19 
 
 		 478 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  42.38 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  41.79 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  42.41 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.72 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  39.84 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.2 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  40.71 
 
 		 510 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  40.84 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>