More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0001 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
454 aa  940    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  60.45 
 
 
446 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  60.31 
 
 
446 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  60.45 
 
 
446 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  60.45 
 
 
446 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  60.45 
 
 
446 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  60.45 
 
 
446 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  60 
 
 
446 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  60.45 
 
 
446 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  60.45 
 
 
446 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  59.69 
 
 
450 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  60.09 
 
 
446 aa  559  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  59.87 
 
 
446 aa  557  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  59.6 
 
 
450 aa  557  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.27 
 
 
453 aa  549  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  54.17 
 
 
457 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  54.17 
 
 
457 aa  518  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  53.44 
 
 
451 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  54.22 
 
 
453 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  54.22 
 
 
453 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  54.88 
 
 
442 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.74 
 
 
463 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  53.93 
 
 
440 aa  504  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  54.42 
 
 
441 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  51.94 
 
 
443 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.97 
 
 
446 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.59 
 
 
449 aa  488  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  52.49 
 
 
436 aa  486  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  52.8 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  52.05 
 
 
443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.68 
 
 
443 aa  460  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.2 
 
 
444 aa  458  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.76 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.67 
 
 
454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.21 
 
 
461 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  46.2 
 
 
459 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  46.87 
 
 
472 aa  425  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.56 
 
 
450 aa  425  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  44.79 
 
 
449 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.74 
 
 
456 aa  423  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  46.29 
 
 
445 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.76 
 
 
439 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.31 
 
 
439 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  43.26 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  46.67 
 
 
460 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  45.51 
 
 
460 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  46.65 
 
 
495 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  46.65 
 
 
495 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  47.13 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  46.65 
 
 
495 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  43.23 
 
 
458 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.82 
 
 
591 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  47.86 
 
 
453 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.34 
 
 
587 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.77 
 
 
480 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  46.76 
 
 
494 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.22 
 
 
458 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  56.8 
 
 
478 aa  411  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  45.54 
 
 
450 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  44.54 
 
 
482 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.21 
 
 
447 aa  410  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  46.3 
 
 
481 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  47.53 
 
 
470 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  45.9 
 
 
456 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  44.25 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  45.09 
 
 
453 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  45.81 
 
 
480 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.68 
 
 
468 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  44.87 
 
 
453 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.71 
 
 
509 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  61.52 
 
 
721 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.51 
 
 
566 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  60.12 
 
 
527 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.33 
 
 
503 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.97 
 
 
528 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  43.13 
 
 
462 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  59.52 
 
 
582 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  46.38 
 
 
450 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 
467 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.4 
 
 
467 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  43.59 
 
 
465 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 
467 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  60.06 
 
 
490 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.52 
 
 
652 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  42.98 
 
 
460 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 
467 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  58.19 
 
 
615 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  55.77 
 
 
597 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 
467 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 
467 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 
467 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  43.4 
 
 
467 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 
467 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  42.98 
 
 
460 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  45.7 
 
 
464 aa  392  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  60.49 
 
 
570 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  44.62 
 
 
454 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  42.49 
 
 
462 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  42.13 
 
 
462 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  43.5 
 
 
466 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>