More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0001 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
472 aa  966    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  66.04 
 
 
481 aa  627  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  64 
 
 
480 aa  624  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  64.06 
 
 
478 aa  608  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.99 
 
 
456 aa  501  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  47.08 
 
 
450 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.73 
 
 
453 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  47.07 
 
 
450 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  47.07 
 
 
457 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  47.07 
 
 
457 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  47.2 
 
 
440 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  46.87 
 
 
446 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  47.08 
 
 
446 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  47.08 
 
 
446 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  46.87 
 
 
446 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  46.87 
 
 
446 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  46.87 
 
 
446 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  46.87 
 
 
446 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  46.84 
 
 
446 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  48.16 
 
 
442 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.62 
 
 
446 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  47.35 
 
 
443 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.37 
 
 
449 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  46.42 
 
 
441 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  46.41 
 
 
446 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.96 
 
 
444 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.16 
 
 
446 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.87 
 
 
454 aa  425  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  45.4 
 
 
443 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.55 
 
 
463 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  46 
 
 
446 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  45.4 
 
 
436 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  43.97 
 
 
451 aa  414  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  44.75 
 
 
453 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  44.75 
 
 
453 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.92 
 
 
453 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.53 
 
 
443 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.64 
 
 
439 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.42 
 
 
439 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  46.97 
 
 
445 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  43.04 
 
 
482 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  46.37 
 
 
470 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.53 
 
 
480 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  43.56 
 
 
460 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  44.23 
 
 
453 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.46 
 
 
454 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  44.37 
 
 
456 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  39.96 
 
 
449 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  43.47 
 
 
452 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.85 
 
 
458 aa  372  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.68 
 
 
447 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  39.48 
 
 
445 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  40.13 
 
 
458 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.98 
 
 
461 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.12 
 
 
509 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  40.52 
 
 
460 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  44.63 
 
 
492 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.14 
 
 
476 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.43 
 
 
587 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.43 
 
 
591 aa  363  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  44.99 
 
 
495 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  44.99 
 
 
495 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  44.99 
 
 
495 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.92 
 
 
527 aa  362  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  43.04 
 
 
494 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  42.08 
 
 
461 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  41.99 
 
 
460 aa  360  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.72 
 
 
721 aa  359  6e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  42.73 
 
 
453 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.15 
 
 
468 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  42.73 
 
 
453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  48.13 
 
 
597 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.89 
 
 
527 aa  356  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  43.21 
 
 
462 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  42.3 
 
 
462 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  42.3 
 
 
462 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  42.3 
 
 
462 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  42.3 
 
 
462 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  41.38 
 
 
460 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  41.38 
 
 
460 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  42.42 
 
 
462 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.36 
 
 
503 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  41.38 
 
 
460 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  42.3 
 
 
461 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  41.38 
 
 
460 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.01 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.5 
 
 
570 aa  353  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  43.21 
 
 
462 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  41.53 
 
 
478 aa  352  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  41.31 
 
 
454 aa  352  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  47.36 
 
 
510 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  40.95 
 
 
459 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  41.24 
 
 
472 aa  350  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  41.05 
 
 
461 aa  350  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  40.9 
 
 
494 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.35 
 
 
528 aa  349  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  42.32 
 
 
452 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  42.32 
 
 
452 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  53.13 
 
 
440 aa  348  1e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  43.2 
 
 
462 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>