More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2371 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  73.36 
 
 		 440 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 443 aa  904    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  63.48 
 
 		 457 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  63.68 
 
 		 457 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  60.36 
 
 		 450 aa  564  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  60.59 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.81 
 
 		 453 aa  556  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  60.73 
 
 		 443 aa  551  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  59.45 
 
 		 441 aa  545  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  59.4 
 
 		 446 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  59.13 
 
 		 446 aa  541  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  59.45 
 
 		 446 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  59.45 
 
 		 446 aa  542  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  59.45 
 
 		 446 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  59.45 
 
 		 446 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  59.45 
 
 		 446 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  59.13 
 
 		 446 aa  541  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  59.23 
 
 		 446 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  59.23 
 
 		 446 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  58.09 
 
 		 446 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.15 
 
 		 463 aa  531  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  58.24 
 
 		 442 aa  525  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  61.78 
 
 		 449 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.5 
 
 		 446 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  56.92 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.16 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.44 
 
 		 454 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.05 
 
 		 454 aa  490  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.89 
 
 		 443 aa  489  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  54.26 
 
 		 451 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  53.9 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  53.9 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  52.67 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.1 
 
 		 453 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  47.35 
 
 		 472 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.24 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  49.22 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.14 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  47.42 
 
 		 445 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  46.74 
 
 		 481 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  46.84 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  47.32 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.12 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  48.03 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.8 
 
 		 447 aa  428  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  47.17 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.56 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  47.01 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  46.78 
 
 		 450 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.33 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  49.44 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  48.02 
 
 		 470 aa  415  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.33 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.23 
 
 		 591 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.23 
 
 		 587 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  48.05 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  48.05 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  46.55 
 
 		 460 aa  398  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.61 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.93 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.57 
 
 		 473 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  47.3 
 
 		 492 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  44.42 
 
 		 482 aa  398  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  47.62 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  47.62 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.63 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  55.75 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  47.62 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.22 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  43.89 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  44.96 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  44.23 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  45.41 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  44.23 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  44.79 
 
 		 460 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  44.23 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  45.41 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  46.74 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  46.74 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  44.44 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  44.23 
 
 		 462 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  45.18 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  45.18 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 		 461 aa  395  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  44.42 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.22 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  45.18 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  44.32 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  44.88 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  44.62 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  61.15 
 
 		 721 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  45.55 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  45.29 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  43.52 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.29 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  43.89 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  45.34 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.78 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.76 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  44.81 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>