More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0001 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
461 aa  959    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  50.11 
 
 
449 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  51.94 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  50.67 
 
 
446 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  51.71 
 
 
446 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  50.67 
 
 
446 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  50.67 
 
 
446 aa  448  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  50.67 
 
 
446 aa  448  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  50.67 
 
 
446 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  50.44 
 
 
446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  50.44 
 
 
446 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  48.67 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  49.44 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  48.91 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  48.91 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  50.89 
 
 
446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  48.12 
 
 
459 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  47.93 
 
 
458 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.85 
 
 
454 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  47.94 
 
 
450 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  48.32 
 
 
445 aa  438  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  47.94 
 
 
450 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.78 
 
 
453 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  48.34 
 
 
450 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  48.34 
 
 
442 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.79 
 
 
446 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  47.67 
 
 
440 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.11 
 
 
463 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  48.52 
 
 
436 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  47.44 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.11 
 
 
449 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  46.56 
 
 
451 aa  414  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  48.28 
 
 
453 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  48.28 
 
 
453 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  48.65 
 
 
450 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  47.32 
 
 
452 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  48.99 
 
 
445 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  44.32 
 
 
443 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.2 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  47.56 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.76 
 
 
444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.88 
 
 
439 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.12 
 
 
439 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.66 
 
 
453 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  45.27 
 
 
460 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  44.57 
 
 
453 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.19 
 
 
587 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.57 
 
 
591 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  44.57 
 
 
482 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  43.2 
 
 
472 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.79 
 
 
455 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  43.47 
 
 
472 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  44.32 
 
 
453 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.48 
 
 
464 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  42.92 
 
 
452 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  42.92 
 
 
452 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  44.89 
 
 
460 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.92 
 
 
483 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.99 
 
 
450 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.51 
 
 
462 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  42.55 
 
 
465 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.69 
 
 
447 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  44.1 
 
 
453 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  49.44 
 
 
494 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0001  chromosomal replication initiation protein  48.5 
 
 
511 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 
466 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 
466 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  47.8 
 
 
468 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  48.01 
 
 
507 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 
466 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  42.42 
 
 
451 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 
466 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  42.58 
 
 
463 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.42 
 
 
451 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.08 
 
 
470 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  44.54 
 
 
470 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  43.99 
 
 
456 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 
466 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  42.33 
 
 
467 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.33 
 
 
467 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  42.33 
 
 
467 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  40.94 
 
 
460 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.5 
 
 
511 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  42.7 
 
 
462 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  47.55 
 
 
468 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  42.33 
 
 
467 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  42.33 
 
 
467 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  42.33 
 
 
467 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  42.33 
 
 
467 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  52.29 
 
 
478 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  48.14 
 
 
511 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  40.94 
 
 
460 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  40.94 
 
 
460 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  43.26 
 
 
451 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  42.7 
 
 
462 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.36 
 
 
454 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  44.34 
 
 
461 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  42.33 
 
 
467 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  40.94 
 
 
460 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  42.73 
 
 
465 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>