More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0001 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  81.05 
 
 		 439 aa  731    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 439 aa  901    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  64.54 
 
 		 470 aa  565  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.95 
 
 		 443 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  52.97 
 
 		 446 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  52.97 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  51.81 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  51.81 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  51.81 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  51.81 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  51.81 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  50.9 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  51.58 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  51.58 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  51.02 
 
 		 450 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  50.45 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  51.81 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  52.4 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  50.45 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  47.83 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  47.83 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.99 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  51.14 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.18 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.98 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.46 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  47.26 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  51.08 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.13 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  51.03 
 
 		 445 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  45.74 
 
 		 449 aa  425  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  48.23 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.01 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.08 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  47.02 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  47.64 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  44.92 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.25 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.39 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  46.43 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  43.42 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.3 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  44.32 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  45.05 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  45.31 
 
 		 451 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  44.84 
 
 		 482 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  45.9 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  45.95 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.17 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  44.87 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  43.3 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  45.05 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  45.05 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  43.02 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  46.49 
 
 		 492 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  48.84 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  48.84 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  48.84 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  46.19 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  45.96 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.93 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.93 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.09 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  44.97 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  44.05 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.03 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  43.24 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  45.25 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  43.38 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.38 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.64 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.89 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  44.35 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  44.08 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.42 
 
 		 462 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  43.38 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  43.38 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  43.38 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.89 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  43.51 
 
 		 467 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  43.76 
 
 		 463 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  45.02 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  44.08 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  43.38 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  43.38 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.67 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  44.16 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  44.16 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  44.49 
 
 		 466 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.77 
 
 		 587 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.13 
 
 		 591 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  44.14 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  44.47 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  44.16 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  43.67 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  44.12 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  41.87 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>