More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0001 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
459 aa  954    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  65.63 
 
 
450 aa  591  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  59.03 
 
 
449 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  56.26 
 
 
450 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  57.08 
 
 
445 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  54.47 
 
 
460 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  54.45 
 
 
458 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  56.22 
 
 
452 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.89 
 
 
453 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  47.81 
 
 
450 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.91 
 
 
461 aa  435  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  48.02 
 
 
450 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  48.54 
 
 
446 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  48.31 
 
 
446 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  48.31 
 
 
446 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  48.31 
 
 
446 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  48.31 
 
 
446 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  48.31 
 
 
446 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  48.31 
 
 
446 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  48.54 
 
 
446 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  48.53 
 
 
446 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  48.53 
 
 
446 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.2 
 
 
454 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  46.93 
 
 
441 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  47.42 
 
 
446 aa  425  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  48.88 
 
 
443 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  48.67 
 
 
440 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.32 
 
 
444 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  46.37 
 
 
457 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  46.86 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  46.24 
 
 
457 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.44 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.74 
 
 
463 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.5 
 
 
446 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  47.01 
 
 
443 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  45.64 
 
 
436 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  46.55 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.45 
 
 
449 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  41.61 
 
 
460 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  41.39 
 
 
460 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.42 
 
 
447 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  42.95 
 
 
449 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.92 
 
 
483 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  41.59 
 
 
462 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.76 
 
 
462 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.42 
 
 
464 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  41.43 
 
 
460 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  42.09 
 
 
461 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  41.43 
 
 
460 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
467 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.95 
 
 
467 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  42.54 
 
 
465 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  43.17 
 
 
467 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
467 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  40.76 
 
 
455 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 
463 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  42.09 
 
 
462 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  42.95 
 
 
467 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  42.09 
 
 
462 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
467 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
467 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
467 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  41.52 
 
 
461 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  41.32 
 
 
462 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  41.93 
 
 
462 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  42.51 
 
 
466 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.02 
 
 
439 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  42.51 
 
 
466 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  41.32 
 
 
462 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  41.32 
 
 
462 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  42.51 
 
 
466 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  41.67 
 
 
472 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 
495 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  42.51 
 
 
466 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  42.83 
 
 
465 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  42.73 
 
 
467 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  42.51 
 
 
466 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  41.32 
 
 
462 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  41.48 
 
 
462 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  42.41 
 
 
451 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.5 
 
 
461 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.58 
 
 
498 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  41.61 
 
 
459 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  40.76 
 
 
461 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  43.16 
 
 
450 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  41.01 
 
 
449 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  39.96 
 
 
457 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.54 
 
 
442 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.95 
 
 
439 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  41.19 
 
 
452 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  41.19 
 
 
452 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.48 
 
 
591 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.82 
 
 
451 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.39 
 
 
467 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000009849  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  40.69 
 
 
468 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  40.51 
 
 
468 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.26 
 
 
474 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  40.82 
 
 
451 aa  365  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.75 
 
 
587 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  40.09 
 
 
478 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>