More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0001 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  82.59 
 
 
446 aa  765    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  82.37 
 
 
446 aa  764    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  82.37 
 
 
446 aa  764    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  82.37 
 
 
446 aa  764    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  94.22 
 
 
450 aa  881    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  82.14 
 
 
446 aa  769    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  82.59 
 
 
446 aa  765    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  82.37 
 
 
446 aa  764    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  82.37 
 
 
446 aa  764    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  83.71 
 
 
446 aa  774    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  82.59 
 
 
446 aa  764    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  82.59 
 
 
446 aa  762    Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
450 aa  925    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  66.67 
 
 
453 aa  624  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  60.88 
 
 
463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  60.4 
 
 
457 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  60.66 
 
 
457 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  64.21 
 
 
449 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.69 
 
 
454 aa  560  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  60.62 
 
 
451 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  60.36 
 
 
453 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  61.54 
 
 
442 aa  555  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  60.36 
 
 
453 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  59.95 
 
 
441 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  60.59 
 
 
443 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  58.11 
 
 
440 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  57.34 
 
 
443 aa  518  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.16 
 
 
446 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  57.37 
 
 
445 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.89 
 
 
443 aa  504  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.53 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  53.78 
 
 
436 aa  504  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.29 
 
 
454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.92 
 
 
450 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  49.67 
 
 
449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  48.42 
 
 
445 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50 
 
 
453 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  48.78 
 
 
450 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  47.07 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.45 
 
 
439 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.11 
 
 
480 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  47.81 
 
 
459 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.88 
 
 
461 aa  435  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  47.47 
 
 
460 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  44.94 
 
 
480 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  47.19 
 
 
458 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.23 
 
 
456 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  47.46 
 
 
460 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.32 
 
 
439 aa  428  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  45.28 
 
 
481 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  46.02 
 
 
482 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.67 
 
 
447 aa  429  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  46.98 
 
 
460 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  48.11 
 
 
456 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  48.12 
 
 
452 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  46.67 
 
 
453 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  47.22 
 
 
453 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  44.23 
 
 
478 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.36 
 
 
509 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  48.91 
 
 
470 aa  418  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  47.22 
 
 
453 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  45.8 
 
 
449 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.65 
 
 
721 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  45.37 
 
 
452 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  45.37 
 
 
452 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.9 
 
 
587 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.16 
 
 
591 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  62.31 
 
 
527 aa  408  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  48.16 
 
 
464 aa  411  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  45 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  57.27 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  45.79 
 
 
461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.8 
 
 
473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  49.55 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  44.49 
 
 
460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  45.31 
 
 
459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  45 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  45 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  45 
 
 
462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  44.97 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  45.1 
 
 
461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  45 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  44.49 
 
 
460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  45.64 
 
 
460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  45.12 
 
 
461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.56 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  45.64 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  45.98 
 
 
457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  45.33 
 
 
455 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  62.02 
 
 
615 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  55.68 
 
 
495 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  44.67 
 
 
462 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  57.41 
 
 
582 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  55.68 
 
 
495 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  55.68 
 
 
495 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.38 
 
 
652 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.37 
 
 
476 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  56.68 
 
 
492 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.05 
 
 
451 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.59 
 
 
528 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>