More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0001 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 453 aa  924    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  52.76 
 
 		 441 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.91 
 
 		 446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  52.1 
 
 		 440 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  52.38 
 
 		 457 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  52.38 
 
 		 457 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.76 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.64 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  49.34 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  53.17 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  50.34 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  53.1 
 
 		 443 aa  441  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  50.9 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  49.89 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  49.44 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  49.02 
 
 		 451 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  50.57 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.58 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.22 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  48.25 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  48.76 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  48.25 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.88 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  49.32 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  46.92 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  52.1 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  45.18 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.42 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.7 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.39 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  45.64 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  44.59 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  45.1 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  52.8 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  43.74 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.01 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.33 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.85 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  44.14 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.19 
 
 		 450 aa  378  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  44.1 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  43.88 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  50.7 
 
 		 492 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.43 
 
 		 587 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.98 
 
 		 480 aa  364  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.74 
 
 		 591 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  51.17 
 
 		 495 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  51.17 
 
 		 495 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  51.17 
 
 		 495 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.52 
 
 		 721 aa  362  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  53.75 
 
 		 494 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  42.45 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  41.06 
 
 		 449 aa  360  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.24 
 
 		 509 aa  359  7e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  43.01 
 
 		 460 aa  359  7e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  43.54 
 
 		 452 aa  358  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  41.48 
 
 		 482 aa  358  8e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.03 
 
 		 528 aa  356  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.71 
 
 		 527 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  40.44 
 
 		 459 aa  353  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  42.08 
 
 		 460 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  39.83 
 
 		 492 aa  350  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  49.71 
 
 		 597 aa  350  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.39 
 
 		 503 aa  349  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  41.89 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  41.89 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.94 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  41.46 
 
 		 454 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.17 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  41.83 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  52.42 
 
 		 464 aa  346  5e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  52.23 
 
 		 582 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.92 
 
 		 490 aa  345  8.999999999999999e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.85 
 
 		 506 aa  345  8.999999999999999e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.19 
 
 		 652 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.59 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.28 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  38.98 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  40.38 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.23 
 
 		 468 aa  343  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.29 
 
 		 534 aa  342  5.999999999999999e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  45.69 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.65 
 
 		 467 aa  342  8e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.22 
 
 		 442 aa  342  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  52.52 
 
 		 615 aa  342  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.98 
 
 		 470 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.28 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  39.36 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0001  chromosomal replication initiation protein  40.74 
 
 		 469 aa  341  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.21 
 
 		 562 aa  341  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000690317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>