More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0001 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
452 aa  920    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000330873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.17 
 
 
453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.44 
 
 
454 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  42.92 
 
 
441 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  42.07 
 
 
443 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  40.49 
 
 
450 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  41.28 
 
 
451 aa  345  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  40.3 
 
 
457 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  40.73 
 
 
457 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42 
 
 
443 aa  343  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  40.84 
 
 
453 aa  342  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  40.84 
 
 
453 aa  342  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
450 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  41.03 
 
 
440 aa  341  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  41.39 
 
 
446 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  40.94 
 
 
446 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.94 
 
 
446 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 
446 aa  339  7e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 
446 aa  339  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 
446 aa  339  7e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 
446 aa  339  7e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 
446 aa  339  7e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  40 
 
 
463 aa  338  8e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.59 
 
 
453 aa  338  9e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  40.18 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  38.39 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 
446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.46 
 
 
446 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  36.49 
 
 
480 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  35.52 
 
 
481 aa  334  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  47.23 
 
 
478 aa  332  8e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.39 
 
 
456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.17 
 
 
444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0001  chromosomal replication initiator protein, DnaA  41.91 
 
 
449 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  36.89 
 
 
472 aa  325  8.000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.23 
 
 
462 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.06 
 
 
464 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.28 
 
 
483 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  38.84 
 
 
472 aa  324  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.62 
 
 
469 aa  324  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.25 
 
 
439 aa  323  5e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.56 
 
 
439 aa  322  6e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  38.33 
 
 
465 aa  322  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  41.48 
 
 
443 aa  322  7e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  37.7 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  37.77 
 
 
465 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  37.71 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  37.71 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  37.71 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  40.5 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.5 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  37.71 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  37.71 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  38.25 
 
 
467 aa  320  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  38.84 
 
 
449 aa  319  6e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  37.77 
 
 
463 aa  319  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  40.88 
 
 
452 aa  319  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  38.25 
 
 
467 aa  319  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  38.25 
 
 
467 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.25 
 
 
467 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  38.25 
 
 
467 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  38.25 
 
 
467 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  38.25 
 
 
467 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  38.25 
 
 
467 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  38.25 
 
 
467 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.71 
 
 
458 aa  318  9e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  39.09 
 
 
449 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 
462 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  38.2 
 
 
462 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.91 
 
 
442 aa  317  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.31 
 
 
449 aa  317  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  37.98 
 
 
461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  37.9 
 
 
468 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  36.17 
 
 
456 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  37.06 
 
 
451 aa  313  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.47 
 
 
447 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.34 
 
 
461 aa  312  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  36.46 
 
 
492 aa  312  9e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  38.99 
 
 
455 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  36.67 
 
 
492 aa  311  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  37.9 
 
 
468 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  38.48 
 
 
478 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.19 
 
 
448 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  37.04 
 
 
468 aa  310  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  37.47 
 
 
462 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  37.47 
 
 
462 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  36.87 
 
 
450 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  36.99 
 
 
460 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  37.77 
 
 
461 aa  310  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  37.47 
 
 
462 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  37.47 
 
 
462 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  38.23 
 
 
460 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  38.63 
 
 
450 aa  309  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  36.99 
 
 
460 aa  308  9e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  37.86 
 
 
462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  36.99 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  34.79 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>