More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0001 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  89.79 
 
 		 480 aa  890    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 481 aa  986    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  66.04 
 
 		 472 aa  627  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  65.62 
 
 		 478 aa  621  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.94 
 
 		 456 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.11 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  46.11 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  45.89 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  45.89 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  45.89 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  45.89 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  45.89 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.27 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  45.86 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.91 
 
 		 453 aa  438  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.86 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  44.54 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  45.28 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  45.05 
 
 		 446 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  44.86 
 
 		 450 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  45.01 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.41 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  45.78 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  44.51 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  44.51 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  44.7 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  46.74 
 
 		 443 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.54 
 
 		 444 aa  415  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.37 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  44.75 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.3 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  44.75 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  46.04 
 
 		 442 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  44.16 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  43.4 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.51 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  42.38 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.43 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  42.77 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.37 
 
 		 454 aa  395  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.59 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  43.1 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  44.35 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.8 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  43.1 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.8 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  41.67 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  44.07 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.58 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  40.84 
 
 		 445 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  42.68 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  42 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.49 
 
 		 509 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.93 
 
 		 587 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  40.66 
 
 		 524 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.93 
 
 		 591 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.27 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  38.74 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  42.56 
 
 		 452 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  42.56 
 
 		 452 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  38.57 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  38.74 
 
 		 449 aa  362  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.67 
 
 		 528 aa  362  9e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  42.26 
 
 		 464 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  42.32 
 
 		 451 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.32 
 
 		 451 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  41.89 
 
 		 461 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  42.28 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  41.74 
 
 		 463 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  40.38 
 
 		 450 aa  358  9e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.07 
 
 		 721 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  41.25 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.56 
 
 		 476 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  42.49 
 
 		 464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.45 
 
 		 468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.35 
 
 		 566 aa  357  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.35 
 
 		 527 aa  356  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  41.79 
 
 		 462 aa  356  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  41.79 
 
 		 462 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  41.63 
 
 		 462 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  45.06 
 
 		 494 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06211  chromosomal replication initiation protein  42.11 
 
 		 464 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.62128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  42.32 
 
 		 478 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  41.39 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  43.37 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  41.01 
 
 		 459 aa  354  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  45.18 
 
 		 492 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  42.49 
 
 		 466 aa  354  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  41.42 
 
 		 465 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  41.39 
 
 		 467 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.39 
 
 		 467 aa  353  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  40.42 
 
 		 462 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  41.39 
 
 		 467 aa  353  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  40.42 
 
 		 462 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  41.39 
 
 		 467 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  41.39 
 
 		 467 aa  353  4e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  40.42 
 
 		 462 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  41.39 
 
 		 467 aa  353  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>