More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_05911 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  70.26 
 
 
463 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  71 
 
 
454 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  71.74 
 
 
466 aa  662    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  95.04 
 
 
464 aa  896    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  80.17 
 
 
463 aa  762    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  71 
 
 
464 aa  658    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
464 aa  963    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06211  chromosomal replication initiation protein  93.97 
 
 
464 aa  866    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.62128  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  67.17 
 
 
462 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0973  chromosomal replication initiation protein  67.93 
 
 
450 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  55.19 
 
 
482 aa  534  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  53.91 
 
 
460 aa  528  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  54.09 
 
 
460 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  52.34 
 
 
456 aa  513  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  52.97 
 
 
453 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  52.31 
 
 
453 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  52.09 
 
 
453 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  45.22 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  45.87 
 
 
446 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  44.52 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.87 
 
 
446 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  45.65 
 
 
446 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  45.65 
 
 
446 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  45.65 
 
 
446 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  45.65 
 
 
446 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  45.65 
 
 
446 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.65 
 
 
446 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  44.9 
 
 
446 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  44.78 
 
 
450 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  44.35 
 
 
450 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.16 
 
 
443 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.17 
 
 
453 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.89 
 
 
463 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
440 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  42.8 
 
 
457 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  41.15 
 
 
451 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  42.26 
 
 
481 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  42.33 
 
 
457 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  43.24 
 
 
441 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  41.46 
 
 
453 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.32 
 
 
454 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  41.46 
 
 
453 aa  373  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  40.08 
 
 
480 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.37 
 
 
449 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.78 
 
 
444 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.96 
 
 
446 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  41.24 
 
 
436 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.68 
 
 
439 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  41.65 
 
 
442 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  42.2 
 
 
445 aa  363  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.36 
 
 
439 aa  362  8e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  43.33 
 
 
470 aa  361  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  40.66 
 
 
443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 
478 aa  356  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40 
 
 
458 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 
449 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  41.52 
 
 
440 aa  349  6e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.3 
 
 
456 aa  349  7e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.92 
 
 
447 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.75 
 
 
591 aa  346  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.75 
 
 
587 aa  347  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.75 
 
 
453 aa  346  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  39.57 
 
 
472 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  41.96 
 
 
443 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  40.71 
 
 
450 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  40.18 
 
 
452 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  40.18 
 
 
452 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 
458 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  39.87 
 
 
460 aa  339  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.39 
 
 
461 aa  338  8e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.43 
 
 
509 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  39.91 
 
 
492 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  37.83 
 
 
459 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.71 
 
 
450 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  40.39 
 
 
452 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.23 
 
 
447 aa  331  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  47.9 
 
 
597 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  47.59 
 
 
494 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.93 
 
 
506 aa  329  7e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.04 
 
 
476 aa  328  9e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  38 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.68 
 
 
480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 
445 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  38.67 
 
 
468 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  47.87 
 
 
495 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  47.87 
 
 
495 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  47.87 
 
 
495 aa  326  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.17 
 
 
454 aa  324  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.85 
 
 
468 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.3 
 
 
566 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  39.6 
 
 
455 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  38.22 
 
 
468 aa  323  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0001  chromosomal replication initiation protein  48.6 
 
 
577 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.59 
 
 
480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.19 
 
 
503 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.97 
 
 
527 aa  320  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.15 
 
 
570 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  36.58 
 
 
495 aa  319  7.999999999999999e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  38.24 
 
 
462 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  38.24 
 
 
462 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>