More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0001 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  71.74 
 
 		 464 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  77.59 
 
 		 463 aa  703    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 466 aa  967    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06211  chromosomal replication initiation protein  74.02 
 
 		 464 aa  676    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.62128  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  98.28 
 
 		 464 aa  944    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  74.68 
 
 		 462 aa  682    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0973  chromosomal replication initiation protein  75.33 
 
 		 450 aa  664    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  72.49 
 
 		 464 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  72.14 
 
 		 463 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  76.62 
 
 		 454 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  59.44 
 
 		 482 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  56.96 
 
 		 460 aa  557  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  57.48 
 
 		 460 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  56.99 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  54.95 
 
 		 453 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  55.16 
 
 		 453 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  53.52 
 
 		 453 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 		 446 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  44.98 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 		 446 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  44.32 
 
 		 446 aa  412  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  44.32 
 
 		 446 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  44.32 
 
 		 446 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  44.32 
 
 		 446 aa  412  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.76 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  44.32 
 
 		 446 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  44.16 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  43.7 
 
 		 450 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  44.2 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  44.2 
 
 		 446 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  43.05 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  43.05 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.27 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  42.2 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.95 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  43.68 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  43.68 
 
 		 457 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.11 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  42.83 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  43.58 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  45.85 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.56 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.88 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.35 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  42.04 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  42.49 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.07 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  41.98 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.49 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.49 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  42.32 
 
 		 442 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  41.16 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.53 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  43.58 
 
 		 443 aa  360  4e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.52 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  42.67 
 
 		 445 aa  358  9e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  40.6 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.49 
 
 		 587 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.49 
 
 		 591 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.73 
 
 		 453 aa  353  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  39.36 
 
 		 478 aa  353  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  39.65 
 
 		 449 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  40.92 
 
 		 450 aa  349  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.3 
 
 		 509 aa  345  7e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  40.09 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  49.7 
 
 		 495 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  49.7 
 
 		 495 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  49.1 
 
 		 494 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  49.7 
 
 		 495 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.13 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 459 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  40.13 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.74 
 
 		 566 aa  339  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.29 
 
 		 476 aa  339  7e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  39.47 
 
 		 492 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  41.01 
 
 		 452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  40.26 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  51.46 
 
 		 597 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.29 
 
 		 454 aa  336  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.42 
 
 		 528 aa  336  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.44 
 
 		 447 aa  335  7e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.17 
 
 		 480 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  41.27 
 
 		 452 aa  332  7.000000000000001e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  41.27 
 
 		 452 aa  332  7.000000000000001e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.87 
 
 		 450 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0001  chromosomal replication initiation protein  51.76 
 
 		 577 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  40.09 
 
 		 507 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.14 
 
 		 570 aa  326  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.58 
 
 		 506 aa  325  9e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.58 
 
 		 721 aa  322  7e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  40.57 
 
 		 450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  39.15 
 
 		 472 aa  319  6e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.53 
 
 		 480 aa  319  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.18 
 
 		 503 aa  316  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.51 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428353  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  38.15 
 
 		 451 aa  315  8e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  38.15 
 
 		 451 aa  315  8e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  39.33 
 
 		 455 aa  315  9e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>