More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0001 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 503 aa  1035    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.6 
 
 		 476 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.8 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.4 
 
 		 476 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  46.72 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  49 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12738  chromosomal replication initiation protein  46.31 
 
 		 475 aa  500  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.843582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.37 
 
 		 480 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  47.08 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.67 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0005  chromosomal replication initiation protein  44.2 
 
 		 475 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  47.28 
 
 		 490 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  46 
 
 		 489 aa  481  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  45.29 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  47.47 
 
 		 487 aa  480  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  46.87 
 
 		 491 aa  478  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  46.48 
 
 		 492 aa  473  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1938  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 		 473 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.33 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.88 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  40.49 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.7 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  39.96 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  41.7 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  40.49 
 
 		 446 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  40.7 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  40.49 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  40.49 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  40.49 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  40.49 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  40.49 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  40.7 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  40.12 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  40.52 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  39.15 
 
 		 449 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  39.8 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.23 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  38.34 
 
 		 524 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  41.33 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  40.08 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  39.47 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  39.68 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  39.68 
 
 		 452 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  37.85 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  39.96 
 
 		 511 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  39.15 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  49 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  49 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  40.08 
 
 		 451 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  37.53 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 512 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.47 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  39.72 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  39.44 
 
 		 460 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  40.65 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  39.55 
 
 		 462 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  39.15 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  39.15 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  39.15 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  39.15 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  38.51 
 
 		 461 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  49.71 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.03 
 
 		 511 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  39.92 
 
 		 514 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  38.74 
 
 		 460 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  38.74 
 
 		 460 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  37.93 
 
 		 462 aa  362  9e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.84 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  38.54 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  39.11 
 
 		 467 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0001  chromosomal replication initiation protein  38.54 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00109258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  39.64 
 
 		 472 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.2 
 
 		 461 aa  360  4e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  39.11 
 
 		 467 aa  360  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.11 
 
 		 467 aa  360  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  39.11 
 
 		 467 aa  360  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  39.11 
 
 		 467 aa  360  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  39.11 
 
 		 467 aa  360  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  39.11 
 
 		 467 aa  360  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  39.76 
 
 		 462 aa  359  7e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.65 
 
 		 516 aa  359  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  39.76 
 
 		 462 aa  359  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  38.54 
 
 		 463 aa  359  7e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0001  chromosomal replication initiation protein  39.72 
 
 		 487 aa  359  8e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000189853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  38.54 
 
 		 461 aa  358  9e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.37 
 
 		 439 aa  358  9e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  37.65 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  39.11 
 
 		 467 aa  358  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  38.06 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  38.91 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.95 
 
 		 464 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  38.55 
 
 		 451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  38.54 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  38.55 
 
 		 451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  40.12 
 
 		 478 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  38.52 
 
 		 507 aa  356  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  39.31 
 
 		 465 aa  356  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.46 
 
 		 439 aa  355  7.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>