More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0001 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 464 aa  960    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  52.88 
 
 		 440 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  49.44 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  48.78 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  48.78 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  48.78 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  48.78 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  48.78 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  48.78 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  48.78 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  49 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  48.78 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  49 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  48.12 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  48.16 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  48.12 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.7 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.45 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  45.3 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  45.83 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  48 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  46.17 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  46.4 
 
 		 445 aa  392  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  46.95 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.54 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  56.93 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  47.13 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  47.24 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  47.33 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.11 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  47.24 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.09 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.59 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.15 
 
 		 443 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  41.85 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  42.48 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  40.76 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  50.45 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  50.45 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.42 
 
 		 453 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44 
 
 		 454 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.62 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.38 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.24 
 
 		 456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.3 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  51.06 
 
 		 524 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  43.17 
 
 		 452 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  39.52 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0001  chromosomal replication initiation protein  44.86 
 
 		 454 aa  349  6e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.22 
 
 		 439 aa  349  7e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.62 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  51.08 
 
 		 494 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  50.46 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.53 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  50.46 
 
 		 505 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  50.46 
 
 		 506 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  50.77 
 
 		 478 aa  347  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0001  chromosomal replication initiation protein  41.28 
 
 		 454 aa  346  5e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  48.96 
 
 		 481 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 511 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  49.25 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  49.85 
 
 		 507 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.15 
 
 		 464 aa  343  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.85 
 
 		 511 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  41.57 
 
 		 455 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0001  chromosomal replication initiation protein  49.85 
 
 		 511 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 465 aa  342  9e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  48.36 
 
 		 472 aa  342  9e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  40.04 
 
 		 459 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 467 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 467 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 467 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.15 
 
 		 462 aa  342  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.15 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  50.15 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  48.66 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.35 
 
 		 470 aa  341  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  50.15 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.85 
 
 		 483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  39.45 
 
 		 492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  49.25 
 
 		 468 aa  340  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0001  chromosomal replication initiation protein  49.85 
 
 		 512 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.77 
 
 		 467 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000009849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.56 
 
 		 527 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  49.1 
 
 		 450 aa  338  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  49.85 
 
 		 514 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.15 
 
 		 503 aa  338  8e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  49.1 
 
 		 462 aa  338  9e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  49.1 
 
 		 463 aa  338  9e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  49.1 
 
 		 462 aa  338  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>