More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0001 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0001  chromosomal replication initiation protein  70 
 
 
453 aa  660    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.817172  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
454 aa  930    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0001  chromosomal replication initiation protein  45.43 
 
 
454 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  44.92 
 
 
453 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  44.92 
 
 
453 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  44.49 
 
 
451 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  43.57 
 
 
450 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  43.68 
 
 
450 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
446 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  43.27 
 
 
446 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.73 
 
 
446 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  42.67 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  43.54 
 
 
440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  42.04 
 
 
446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  41.41 
 
 
457 aa  352  8e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  41.19 
 
 
457 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  41.96 
 
 
441 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.88 
 
 
449 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  43.08 
 
 
443 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.05 
 
 
453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  47.78 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  41.28 
 
 
464 aa  333  3e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.55 
 
 
443 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.86 
 
 
454 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  39.69 
 
 
440 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.99 
 
 
454 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.6 
 
 
446 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  39.06 
 
 
472 aa  322  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.54 
 
 
463 aa  322  8e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  39.64 
 
 
436 aa  318  9e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  40.41 
 
 
445 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  44.27 
 
 
478 aa  317  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  45.51 
 
 
451 aa  316  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  45.48 
 
 
460 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  45.48 
 
 
458 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  38.91 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  39.23 
 
 
452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  39.23 
 
 
452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.44 
 
 
587 aa  312  7.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.04 
 
 
444 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  38.36 
 
 
481 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  44.63 
 
 
467 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  39.73 
 
 
443 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  44.92 
 
 
467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.45 
 
 
467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000009849  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  44.92 
 
 
467 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.92 
 
 
467 aa  310  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  44.92 
 
 
467 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  44.92 
 
 
467 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  44.92 
 
 
467 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  44.92 
 
 
467 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  41.28 
 
 
445 aa  310  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.61 
 
 
591 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  44.92 
 
 
467 aa  309  8e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  38.94 
 
 
452 aa  309  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  45.92 
 
 
466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  44.38 
 
 
451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  45.92 
 
 
466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.31 
 
 
447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  45.92 
 
 
466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  44.38 
 
 
451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  45.92 
 
 
466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  45.92 
 
 
466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.95 
 
 
462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  39.11 
 
 
472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.92 
 
 
483 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.97 
 
 
464 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.21 
 
 
480 aa  307  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  46.44 
 
 
468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  44.77 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  44.81 
 
 
524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  46.32 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  46.32 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  44.74 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.12 
 
 
450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.52 
 
 
453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.64 
 
 
527 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  41.41 
 
 
449 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  45.65 
 
 
462 aa  302  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  45.65 
 
 
462 aa  302  9e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  45.82 
 
 
468 aa  302  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  45.65 
 
 
450 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.72 
 
 
456 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.71 
 
 
503 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  45.13 
 
 
459 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.62 
 
 
455 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.63 
 
 
461 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.38 
 
 
515 aa  299  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  45.15 
 
 
463 aa  299  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  45.2 
 
 
468 aa  298  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  37.45 
 
 
482 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.61 
 
 
562 aa  298  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000690317  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  43.14 
 
 
461 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  44.14 
 
 
457 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>