262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2535 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  100 
 
 		 247 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  40.28 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  39.25 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  38.12 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  39.35 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  38.14 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  41.44 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  38.64 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  36.87 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  35.48 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  35.04 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  39.21 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  33.48 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  34.96 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  34.55 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  32.89 
 
 		 233 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  34.84 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  36.28 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  35.43 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  35.59 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  35.29 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  32.31 
 
 		 237 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  34.98 
 
 		 226 aa  89  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  36.57 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  32.75 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  36.23 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  29.22 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  36.57 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  40.6 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  35.24 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  25.63 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  33.5 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  42.25 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  36.11 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  25.63 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  33.95 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  35.84 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  36.51 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  36.28 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  22.4 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1916  DNA replication initiation factor  31.7 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1412  chromosomal replication initiator, DnaA  29.29 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  27.49 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2441  DNA replication initiation factor  28.57 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689375  normal  0.0202229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0747  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  27.23 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0524633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  30.41 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3180  DnaA regulatory inactivator Hda  32.61 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1838  DNA replication initiation factor  28.31 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0197732  normal  0.185347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1967  DNA replication initiation factor  29.82 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187389  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1691  DNA replication initiation factor  29.49 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482582  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  30.99 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  32.16 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  27.7 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3317  Chromosomal replication initiator DnaA  26.64 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.159079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0929  Chromosomal replication initiator DnaA  27.27 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6289100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2877  DNA replication initiation factor  28.57 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  29.49 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  32.95 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  28.57 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3022  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  34.41 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  28.57 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.44 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  28.57 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1078  chromosomal replication initiator protein DnaA, truncation  26.81 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.648855  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0673  DnaA regulatory inactivator Hda  32.07 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2499  DNA replication initiation factor  28.11 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  30.29 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1823  DNA replication initiation factor  28.11 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000711754  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1779  DNA replication initiation factor  28.11 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000277265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1786  DNA replication initiation factor  28.11 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000114863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  32.95 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  31.74 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1067  DNA replication initiation factor  27.14 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  28.96 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  29.59 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  34.92 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  29.09 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  27.72 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  29.82 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  28.84 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  27.32 
 
 		 455 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  28.84 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  29.08 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  28.84 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  24.06 
 
 		 492 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  29.86 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.87 
 
 		 469 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3184  DNA replication initiation factor  27.57 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  27.24 
 
 		 449 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2174  Chromosomal replication initiator DnaA  27.03 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.89 
 
 		 454 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  26.76 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  23.73 
 
 		 442 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  27.27 
 
 		 533 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.59 
 
 		 490 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  27.57 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  28.29 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  28.37 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>