More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0399 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  100 
 
 		 226 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  93.81 
 
 		 226 aa  410  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  93.36 
 
 		 226 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  54.09 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  56.56 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  52.49 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  48.33 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  49.52 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  51.13 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  49.31 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  47.98 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  47.93 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  46.95 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  46.54 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  46.08 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  45.16 
 
 		 252 aa  167  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  45.16 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  45.16 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  45.62 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  46.08 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  46.08 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  44.24 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  44.5 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  44.5 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  43.58 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  41.96 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  42.08 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  41.63 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  46.19 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  35.71 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  44.5 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  36.28 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  35.84 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  37.28 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  40.72 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  41.67 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  37.67 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  28.43 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  28.43 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  27.37 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  33.04 
 
 		 207 aa  98.6  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  33.33 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  32 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  36.61 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.02 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  31.94 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  34.82 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0747  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  28.4 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0524633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  27.83 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  33 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1779  DNA replication initiation factor  31.38 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000277265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1786  DNA replication initiation factor  31.38 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000114863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1823  DNA replication initiation factor  31.38 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000711754  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2499  DNA replication initiation factor  31.38 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  32.52 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  23.61 
 
 		 453 aa  68.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1691  DNA replication initiation factor  30.85 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1967  DNA replication initiation factor  29.84 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1412  chromosomal replication initiator, DnaA  27.27 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1916  DNA replication initiation factor  29.79 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  30.73 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  25.58 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2877  DNA replication initiation factor  30.43 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  29.26 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  30.43 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  30.43 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  28.12 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  30.43 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1078  chromosomal replication initiator protein DnaA, truncation  26.75 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.648855  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  28.64 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  28.42 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3317  Chromosomal replication initiator DnaA  23.25 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.159079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  28.64 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  28.64 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  27.36 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3519  DNA replication initiation factor  30.11 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222662  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3184  DNA replication initiation factor  27.36 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  25.41 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  29.69 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  27.13 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  28.17 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  29.69 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  28.04 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1173  DnaA regulatory inactivator Hda  27.75 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00363629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  29.17 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2779  DNA replication initiation factor  27.75 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00316092  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0001  chromosomal replication initiation protein  22.65 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2643  DNA replication initiation factor  28.37 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000240374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3180  DnaA regulatory inactivator Hda  30.13 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  27.75 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  29.17 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0896  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  26.52 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2643  DNA replication initiation factor  27.75 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.029874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2691  DNA replication initiation factor  28.37 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.994439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2870  DNA replication initiation factor  27.75 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2864  DNA replication initiation factor  28.37 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2441  DNA replication initiation factor  29.1 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689375  normal  0.0202229 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  30.09 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2733  DNA replication initiation factor  28.37 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3718  DNA replication initiation factor  27.75 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>