138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1249 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  100 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  38.67 
 
 
231 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  38.22 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  38.77 
 
 
233 aa  144  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  36.7 
 
 
232 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  43.12 
 
 
226 aa  138  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  44.8 
 
 
228 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  40.72 
 
 
226 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  41.63 
 
 
226 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  43.06 
 
 
236 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  42.41 
 
 
229 aa  134  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  41.63 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  41.18 
 
 
226 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  40.53 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  40.83 
 
 
225 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  42.92 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  32.88 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  41.47 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  41.47 
 
 
252 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  42.78 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  42.78 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  40.72 
 
 
240 aa  128  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  36.94 
 
 
225 aa  128  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  41.01 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  41.67 
 
 
237 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  39.53 
 
 
225 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  39.21 
 
 
229 aa  121  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  39.63 
 
 
228 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  38.67 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  41.18 
 
 
255 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  37.95 
 
 
233 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  33.65 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  40.19 
 
 
233 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  36.24 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  38.01 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  41.36 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  33.64 
 
 
204 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  39.07 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  36.28 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  34.96 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  31.86 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  26.8 
 
 
211 aa  87  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  26.26 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  34.05 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  28.77 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  32.05 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  25.76 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  32.63 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  32.07 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  30.77 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  29.11 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  30 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  24.56 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  29.57 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  26.88 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  29.49 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  29.57 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  29.49 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  29.11 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  28.7 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2877  DNA replication initiation factor  32.24 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  31.69 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  31.69 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  31.69 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  28.88 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  30.04 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1967  DNA replication initiation factor  28.26 
 
 
236 aa  62.4  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2499  DNA replication initiation factor  31.02 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1786  DNA replication initiation factor  31.02 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000114863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1779  DNA replication initiation factor  31.02 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000277265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1823  DNA replication initiation factor  31.02 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000711754  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  28.63 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  30.26 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1838  DNA replication initiation factor  29.35 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0197732  normal  0.185347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1691  DNA replication initiation factor  30.48 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2616  DnaA regulatory inactivator Hda  29.21 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  32.33 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  30.52 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  27.89 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  27.72 
 
 
236 aa  58.9  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  28.95 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1916  DNA replication initiation factor  27.42 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  23.94 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2441  DNA replication initiation factor  30.46 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689375  normal  0.0202229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.43 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  29.12 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  22.65 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  24.15 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  23.61 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  22.84 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0747  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  26.86 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0524633  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  23.73 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  23.73 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  23.61 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1078  chromosomal replication initiator protein DnaA, truncation  26.36 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.648855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  28.88 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2320  chromosomal replication initiator, DnaA  29.57 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1173  DnaA regulatory inactivator Hda  25.86 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00363629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2779  DNA replication initiation factor  25.86 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00316092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  25.86 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0260346 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>