117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0493 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  100 
 
 		 236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  71.74 
 
 		 252 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  72.57 
 
 		 252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  72.12 
 
 		 252 aa  318  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  70.97 
 
 		 233 aa  288  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  69.67 
 
 		 233 aa  268  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  55.07 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  49.77 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  51.83 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  50.92 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  52.65 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  50.92 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  49.08 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  50 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  47.77 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  52.05 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  48.39 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  47.98 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  47.93 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  44.25 
 
 		 233 aa  168  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  47.87 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  47.44 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  46.3 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  49.56 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  43.1 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  41.81 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  47.09 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  41.99 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  38.91 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  43.17 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  39.38 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  38.94 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  40.95 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  40.48 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  43.06 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  26.7 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  27.06 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  37.61 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  39.74 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  28.16 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  33.5 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  34.62 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  39.21 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  31.78 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3317  Chromosomal replication initiator DnaA  28.87 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.159079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0929  Chromosomal replication initiator DnaA  28.87 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6289100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0747  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.54 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0524633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  33.75 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1412  chromosomal replication initiator, DnaA  28.86 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.71 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  29.86 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  34.91 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  35.09 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  32.19 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1078  chromosomal replication initiator protein DnaA, truncation  26.14 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.648855  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  32.43 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  34.72 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.41 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  27.59 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  30.88 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  30.57 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  27.04 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  30.39 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  33.33 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  30.39 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  30.39 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  30.1 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.18 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  26.64 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0896  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  25.53 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0654  DnaA regulatory inactivator Hda  24.69 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0679  DnaA regulatory inactivator Hda  24.69 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  32.17 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3847  DnaA regulatory inactivator Hda  24.27 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0276  DnaA regulatory inactivator Hda  24.69 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0760  DnaA regulatory inactivator Hda  24.69 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2441  DNA replication initiation factor  26.36 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689375  normal  0.0202229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  24.69 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  29.9 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  31.86 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1838  DNA replication initiation factor  28.8 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0197732  normal  0.185347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  28.43 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  28.92 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  25.94 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2174  Chromosomal replication initiator DnaA  42.11 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  26.2 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1967  DNA replication initiation factor  25.63 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187389  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0673  DnaA regulatory inactivator Hda  28.18 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2625  DnaA regulatory inactivator Hda  25.94 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2320  chromosomal replication initiator, DnaA  29.6 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107711  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0001  chromosomal replication initiation protein  23.87 
 
 		 442 aa  46.2  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  26.4 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1466  DnaA regulatory inactivator Hda  26.52 
 
 		 233 aa  45.1  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.14 
 
 		 448 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.37 
 
 		 587 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1691  DNA replication initiation factor  26.04 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482582  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  20.26 
 
 		 436 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.37 
 
 		 591 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.44 
 
 		 477 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  26.04 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>