276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0234 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  100 
 
 		 255 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  37.39 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  39.64 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  38.91 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  38.46 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  37.5 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  36.73 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  36.17 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  36.17 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  41.18 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  36.4 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  37.1 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  36.7 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  33.04 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  35.78 
 
 		 229 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  33.48 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  32.89 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  38.5 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  37.61 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  37.67 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  38.29 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  34.19 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  34.19 
 
 		 231 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  36.2 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  36.96 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  36.77 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  37.22 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  38.5 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  39.46 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  36.77 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  32.31 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  40.77 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  33.78 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  36.48 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  23.44 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  29.72 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  37.91 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  23.78 
 
 		 218 aa  89  7e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  27.06 
 
 		 229 aa  88.6  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  23.78 
 
 		 218 aa  85.9  6e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  27.32 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  34.68 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  34.41 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  35.48 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  35.48 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  32.86 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  34.41 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  34.41 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  34.41 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  33.87 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  30.37 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  32.8 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  32.8 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  27.78 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  30.65 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  32.8 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  32.26 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  27.23 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  30.89 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  35.78 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  34.43 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  33.5 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2174  Chromosomal replication initiator DnaA  28.16 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0673  DnaA regulatory inactivator Hda  35.83 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  27.32 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  27.32 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  33.73 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3022  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  34.38 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.77 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  25.25 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  28.89 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  32.57 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.79 
 
 		 450 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1691  DNA replication initiation factor  25.74 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  34.57 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  28.64 
 
 		 455 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  28.64 
 
 		 455 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1779  DNA replication initiation factor  26.94 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000277265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1823  DNA replication initiation factor  26.94 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000711754  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1786  DNA replication initiation factor  26.94 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000114863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2499  DNA replication initiation factor  26.94 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  29.47 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2877  DNA replication initiation factor  25.32 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  25.32 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  25.32 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  25.32 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  28.16 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  25.37 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  25.54 
 
 		 533 aa  57  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  24.07 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  24.07 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1438  DNA replication initiation ATPase-like protein  30.89 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000684116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  23.27 
 
 		 463 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  29.69 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2441  DNA replication initiation factor  26.4 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689375  normal  0.0202229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  22.46 
 
 		 446 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  25.94 
 
 		 456 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  30.25 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0747  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  26.05 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0524633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0896  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  25.96 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>