163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1298 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  100 
 
 		 232 aa  454  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  54.63 
 
 		 252 aa  228  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  54.19 
 
 		 252 aa  227  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  53.3 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  56.82 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  55.07 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  55.87 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  57.73 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  44.29 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  44.5 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  44.59 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  40.89 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  43.32 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  42.08 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  42.27 
 
 		 229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  42.92 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  42.29 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  41.41 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  40.62 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  40.09 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  44.95 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  40.18 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  44.5 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  44.5 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  41.75 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  44.29 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  42.22 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  42.38 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  36.21 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  45.66 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  36.16 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  35.71 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  33.78 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  41.26 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  40.27 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  36.24 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  36.96 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  27.52 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  27.06 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  27.23 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  33.5 
 
 		 207 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0747  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  28.63 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0524633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  28.37 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  35.43 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1078  chromosomal replication initiator protein DnaA, truncation  27.69 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.648855  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  28.79 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  30.7 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3317  Chromosomal replication initiator DnaA  26.43 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.159079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1412  chromosomal replication initiator, DnaA  25.94 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0929  Chromosomal replication initiator DnaA  24.78 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6289100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  23.11 
 
 		 436 aa  62  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  23.65 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  23.24 
 
 		 440 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  23.24 
 
 		 440 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2174  Chromosomal replication initiator DnaA  27.65 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.75 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2320  chromosomal replication initiator, DnaA  29.28 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107711  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0001  chromosomal replication initiation protein  21.16 
 
 		 442 aa  54.3  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  30.61 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.27 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  32.07 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  30.37 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  23.58 
 
 		 440 aa  51.6  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.89 
 
 		 454 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000297027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  28.63 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  30.73 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  28.34 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25 
 
 		 437 aa  50.4  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.11482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.3 
 
 		 527 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  31.89 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  31.89 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  25.75 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0001  chromosomal replication initiation protein  24.87 
 
 		 435 aa  48.9  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3953  DnaA regulatory inactivator Hda  27.19 
 
 		 256 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082136 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.51 
 
 		 448 aa  48.9  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3847  DnaA regulatory inactivator Hda  25.83 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0673  DnaA regulatory inactivator Hda  27.06 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0746  DnaA regulatory inactivator Hda  25.99 
 
 		 256 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.653326 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2318  DnaA regulatory inactivator Hda  27.23 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3312  DnaA regulatory inactivator Hda  27.23 
 
 		 332 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1316  DnaA regulatory inactivator Hda  27.03 
 
 		 334 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0581271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0276  DnaA regulatory inactivator Hda  25.83 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0654  DnaA regulatory inactivator Hda  26.01 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0760  DnaA regulatory inactivator Hda  25.83 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0679  DnaA regulatory inactivator Hda  26.01 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  25 
 
 		 436 aa  48.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  25.83 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0509  DnaA regulatory inactivator Hda  27.23 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.679706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1090  DnaA regulatory inactivator Hda  27.23 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3269  DnaA regulatory inactivator Hda  27.23 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0915676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3302  DnaA regulatory inactivator Hda  27.23 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2197  DnaA regulatory inactivator Hda  27.23 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369368  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  26.63 
 
 		 462 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  28.19 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  31.52 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  26.63 
 
 		 450 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.89 
 
 		 460 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  26.63 
 
 		 462 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  25.79 
 
 		 463 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>