299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02244 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  448  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  67.24 
 
 
235 aa  312  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  70 
 
 
233 aa  306  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  70 
 
 
233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  41.85 
 
 
232 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  38.77 
 
 
236 aa  138  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1071  chromosomal replication initiator, DnaA  36.21 
 
 
242 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163045  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  37.93 
 
 
261 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2441  DNA replication initiation factor  38.33 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689375  normal  0.0202229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  38.36 
 
 
234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  37.5 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.66 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1967  DNA replication initiation factor  37.44 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  39.66 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1838  DNA replication initiation factor  38.77 
 
 
236 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0197732  normal  0.185347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1779  DNA replication initiation factor  37.72 
 
 
236 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000277265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2499  DNA replication initiation factor  37.72 
 
 
236 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  37.93 
 
 
234 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1786  DNA replication initiation factor  37.72 
 
 
236 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000114863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1823  DNA replication initiation factor  37.72 
 
 
236 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000711754  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  40.17 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  37.72 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  37.72 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  37.72 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2877  DNA replication initiation factor  37.28 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1691  DNA replication initiation factor  37.28 
 
 
236 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1916  DNA replication initiation factor  38.16 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02388  DNA replication initiation factor  37 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1173  DnaA regulatory inactivator Hda  37 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00363629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02350  hypothetical protein  37 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0140211  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2643  DNA replication initiation factor  37 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.029874  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2631  DNA replication initiation factor  37 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.127472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  37 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2779  DNA replication initiation factor  37 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00316092  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  35.24 
 
 
236 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3718  DNA replication initiation factor  37 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287428  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2870  DNA replication initiation factor  37 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  38.43 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  35.24 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  35.84 
 
 
235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  35.84 
 
 
239 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  35.84 
 
 
239 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1067  DNA replication initiation factor  34.96 
 
 
235 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2864  DNA replication initiation factor  36.12 
 
 
241 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2755  DNA replication initiation factor  36.12 
 
 
241 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2691  DNA replication initiation factor  36.12 
 
 
241 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.994439  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2733  DNA replication initiation factor  36.12 
 
 
241 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176133  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2643  DNA replication initiation factor  36.12 
 
 
241 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000240374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  35.34 
 
 
234 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  35.34 
 
 
234 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  36.84 
 
 
235 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  36.84 
 
 
235 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  34.96 
 
 
235 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  35.4 
 
 
235 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  32.89 
 
 
260 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  32.89 
 
 
237 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  36.84 
 
 
235 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02146  Chromosomal replication initiator, DnaA like protein to DnaA protein Hda  34.71 
 
 
245 aa  121  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2487  chromosomal replication initiator, DnaA  32.76 
 
 
237 aa  121  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  39.06 
 
 
245 aa  121  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  36.4 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3184  DNA replication initiation factor  34.51 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  34.36 
 
 
230 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  34.36 
 
 
230 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  37.05 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  36.09 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  32.31 
 
 
235 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  35.98 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0896  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  33.91 
 
 
239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1901  hypothetical protein  37.23 
 
 
236 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.198388  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  40.35 
 
 
243 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1576  DnaA regulatory inactivator Hda  37.23 
 
 
237 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.298764  hitchhiker  0.00654895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2984  DNA replication initiation factor  35.26 
 
 
197 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.0618284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3519  DNA replication initiation factor  32.34 
 
 
203 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222662  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  38.63 
 
 
230 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2625  DnaA regulatory inactivator Hda  35.74 
 
 
315 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0746  DnaA regulatory inactivator Hda  35.98 
 
 
256 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.653326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0276  DnaA regulatory inactivator Hda  36.21 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  36.21 
 
 
244 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0760  DnaA regulatory inactivator Hda  36.21 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0679  DnaA regulatory inactivator Hda  36.36 
 
 
318 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525991  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0654  DnaA regulatory inactivator Hda  36.36 
 
 
318 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3847  DnaA regulatory inactivator Hda  35.78 
 
 
244 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3953  DnaA regulatory inactivator Hda  35.56 
 
 
256 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082136 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2197  DnaA regulatory inactivator Hda  35.65 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2318  DnaA regulatory inactivator Hda  35.65 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1090  DnaA regulatory inactivator Hda  35.65 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3302  DnaA regulatory inactivator Hda  35.65 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3269  DnaA regulatory inactivator Hda  35.65 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0915676  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0509  DnaA regulatory inactivator Hda  35.65 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.679706  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3312  DnaA regulatory inactivator Hda  36.8 
 
 
332 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1316  DnaA regulatory inactivator Hda  36.8 
 
 
334 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0581271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2489  DnaA regulatory inactivator Hda  35.93 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0673  DnaA regulatory inactivator Hda  34.2 
 
 
225 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1763  chromosomal replication initiator, DnaA  33.2 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2625  DnaA regulatory inactivator Hda  34.71 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0949  chromosomal replication initiator, DnaA  31.3 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2775  DnaA regulatory inactivator Hda  32.77 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00936325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2860  DnaA regulatory inactivator Hda  33.05 
 
 
233 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2454  DnaA regulatory inactivator Hda  33.05 
 
 
233 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>