144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1755 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  100 
 
 		 220 aa  434  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  49.75 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  42.23 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  35.45 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  35.87 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  35.87 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  35.15 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  36.07 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  32.13 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  34.53 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  33.94 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  34.98 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  34.84 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  32.74 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  34.91 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  33.18 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  33.82 
 
 		 240 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  33.33 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  31.84 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  31.39 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  32.84 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  32.84 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  28.42 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  31.63 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  32.34 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  29.59 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  32.04 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  29.25 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  31.86 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  32.51 
 
 		 226 aa  84.7  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  28.25 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  31.78 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  30.63 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  32.05 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  30.62 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  38.21 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  30.62 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  28.37 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  31.82 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  35.9 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  37.29 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  37.29 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  29.3 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  34.19 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  26.2 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  26.2 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  30.23 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  36.75 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  37.29 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  36.44 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  36.44 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  36.44 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  33.33 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  33.33 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  37.19 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  31.62 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  23.08 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  27.27 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  28.4 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  31.62 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  22.15 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  26.8 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  32.77 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  20.89 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0896  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.91 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  32.48 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.82 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  33.33 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  28.79 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3184  DNA replication initiation factor  28.79 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2984  DNA replication initiation factor  29.75 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.0618284 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  30.16 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  31.4 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  31.4 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  29.46 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1067  DNA replication initiation factor  27.27 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  28.1 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02388  DNA replication initiation factor  29.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1173  DnaA regulatory inactivator Hda  29.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00363629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3718  DNA replication initiation factor  29.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2755  DNA replication initiation factor  29.63 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2643  DNA replication initiation factor  29.63 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000240374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02350  hypothetical protein  29.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0140211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2691  DNA replication initiation factor  29.63 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.994439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2864  DNA replication initiation factor  29.63 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2870  DNA replication initiation factor  29.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2733  DNA replication initiation factor  29.63 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2631  DNA replication initiation factor  29.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.127472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2779  DNA replication initiation factor  29.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00316092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  29.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2643  DNA replication initiation factor  29.75 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.029874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02146  Chromosomal replication initiator, DnaA like protein to DnaA protein Hda  27.97 
 
 		 245 aa  48.5  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3180  DnaA regulatory inactivator Hda  29.37 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1901  hypothetical protein  27.35 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.198388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1576  DnaA regulatory inactivator Hda  27.35 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.298764  hitchhiker  0.00654895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  27.12 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3519  DNA replication initiation factor  28.57 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222662  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  27.12 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  27.12 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  30.37 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>