More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1901 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1901  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.198388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1576  DnaA regulatory inactivator Hda  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.298764  hitchhiker  0.00654895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  38.26 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  38.26 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  38.26 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  36.91 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  36.91 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  37.39 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  37.77 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  36.09 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  35.19 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  34.76 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  36.29 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  36.09 
 
 		 233 aa  111  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  35.74 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  35.34 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  36.55 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  35.34 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  35.34 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  33.9 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  33.9 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  33.9 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2877  DNA replication initiation factor  34.91 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  34.32 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3184  DNA replication initiation factor  34.75 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  30.3 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.34 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1916  DNA replication initiation factor  33.62 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1779  DNA replication initiation factor  33.62 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000277265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1823  DNA replication initiation factor  33.62 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000711754  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2499  DNA replication initiation factor  33.62 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1786  DNA replication initiation factor  33.62 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000114863  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  37.29 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  33.91 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  30.4 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  30.4 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1691  DNA replication initiation factor  33.62 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1967  DNA replication initiation factor  33.48 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  35 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02388  DNA replication initiation factor  31.49 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1173  DnaA regulatory inactivator Hda  31.49 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00363629  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2691  DNA replication initiation factor  31.91 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.994439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1067  DNA replication initiation factor  32.2 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2779  DNA replication initiation factor  31.49 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00316092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2733  DNA replication initiation factor  31.91 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2755  DNA replication initiation factor  31.91 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2643  DNA replication initiation factor  31.49 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.029874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1838  DNA replication initiation factor  33.77 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0197732  normal  0.185347 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2870  DNA replication initiation factor  31.49 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2864  DNA replication initiation factor  31.91 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2631  DNA replication initiation factor  31.49 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.127472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3718  DNA replication initiation factor  31.49 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  34.05 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  31.49 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2643  DNA replication initiation factor  31.91 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000240374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02350  hypothetical protein  31.49 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0140211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  33.47 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2441  DNA replication initiation factor  32.75 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689375  normal  0.0202229 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  34.93 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  32.49 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  32.49 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  33.48 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  31.36 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  33.05 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3519  DNA replication initiation factor  31.28 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222662  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1071  chromosomal replication initiator, DnaA  29.36 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2320  chromosomal replication initiator, DnaA  29.44 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107711  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  33.47 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2984  DNA replication initiation factor  31.79 
 
 		 197 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.0618284 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  32.05 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  29.23 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  34.62 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  31.9 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02146  Chromosomal replication initiator, DnaA like protein to DnaA protein Hda  30.85 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2775  DnaA regulatory inactivator Hda  30.34 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00936325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2912  DnaA regulatory inactivator Hda  29.79 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2318  DnaA regulatory inactivator Hda  32.22 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1090  DnaA regulatory inactivator Hda  32.22 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3269  DnaA regulatory inactivator Hda  32.22 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0915676  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2616  DnaA regulatory inactivator Hda  30.14 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1316  DnaA regulatory inactivator Hda  32.37 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0581271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2197  DnaA regulatory inactivator Hda  32.22 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3302  DnaA regulatory inactivator Hda  32.22 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0509  DnaA regulatory inactivator Hda  32.22 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.679706  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3312  DnaA regulatory inactivator Hda  32.22 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1078  chromosomal replication initiator protein DnaA, truncation  28.43 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.648855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0204  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.02 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2487  chromosomal replication initiator, DnaA  26.56 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3180  DnaA regulatory inactivator Hda  30.9 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0896  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  27.23 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0747  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  25.52 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0524633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0949  chromosomal replication initiator, DnaA  27.47 
 
 		 232 aa  72  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.68 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  26.76 
 
 		 461 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  26.76 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  26.76 
 
 		 457 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  26.76 
 
 		 460 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  26.76 
 
 		 462 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  26.76 
 
 		 460 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  26.76 
 
 		 460 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>