More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4562 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  99.57 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  79.91 
 
 		 234 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  81.2 
 
 		 234 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  81.2 
 
 		 261 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  80.77 
 
 		 234 aa  387  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  79.06 
 
 		 234 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  79.74 
 
 		 235 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  79.74 
 
 		 235 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  78.88 
 
 		 235 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  79.74 
 
 		 235 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2110  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  53.02 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.519557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  47.6 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  47.6 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  47.84 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  47.84 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  47.84 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  46.98 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3184  DNA replication initiation factor  47.41 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02388  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1173  DnaA regulatory inactivator Hda  47.19 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00363629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2631  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.127472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2779  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00316092  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2643  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.029874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2733  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2691  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.994439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2755  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2864  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3718  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02350  hypothetical protein  47.19 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0140211  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2870  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2643  DNA replication initiation factor  47.19 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000240374  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  45.26 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1916  DNA replication initiation factor  46.32 
 
 		 241 aa  205  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.139395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1067  DNA replication initiation factor  46.12 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  44.83 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0896  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  46.78 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  45.26 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1779  DNA replication initiation factor  45.26 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000277265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1786  DNA replication initiation factor  45.26 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000114863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1823  DNA replication initiation factor  45.26 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000711754  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2499  DNA replication initiation factor  45.26 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1838  DNA replication initiation factor  45.69 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0197732  normal  0.185347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1691  DNA replication initiation factor  45.26 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  44.83 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1071  chromosomal replication initiator, DnaA  44.49 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163045  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  43.23 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2441  DNA replication initiation factor  44.4 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689375  normal  0.0202229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2877  DNA replication initiation factor  44.4 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  42.79 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  44.4 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  44.4 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  44.4 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1967  DNA replication initiation factor  43.1 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2984  DNA replication initiation factor  49.46 
 
 		 197 aa  188  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.0618284 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  42.06 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  44.3 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3519  DNA replication initiation factor  49.21 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222662  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  43.91 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.54 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  39.57 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  40.43 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0949  chromosomal replication initiator, DnaA  39.32 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2487  chromosomal replication initiator, DnaA  38.79 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  42.98 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  43.23 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02146  Chromosomal replication initiator, DnaA like protein to DnaA protein Hda  32.92 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0119761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  38.89 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  38.89 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2616  DnaA regulatory inactivator Hda  34.56 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  35.34 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2775  DnaA regulatory inactivator Hda  34.71 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00936325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  33.19 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1901  hypothetical protein  36.91 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.198388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1576  DnaA regulatory inactivator Hda  36.91 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.298764  hitchhiker  0.00654895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  37.07 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  33.04 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1048  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.78 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3953  DnaA regulatory inactivator Hda  35.5 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2912  DnaA regulatory inactivator Hda  35.95 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0746  DnaA regulatory inactivator Hda  35.06 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.653326 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1622  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  31.6 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000450483  normal  0.228379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0222  hypothetical protein  34.48 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0660424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1316  DnaA regulatory inactivator Hda  35.44 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0581271  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1854  putative DnaA family protein  31.13 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00022151  normal  0.136094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2489  DnaA regulatory inactivator Hda  34.75 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3302  DnaA regulatory inactivator Hda  35.02 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0509  DnaA regulatory inactivator Hda  35.02 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.679706  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2318  DnaA regulatory inactivator Hda  35.02 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1090  DnaA regulatory inactivator Hda  35.02 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3269  DnaA regulatory inactivator Hda  35.02 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0915676  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2197  DnaA regulatory inactivator Hda  35.02 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3312  DnaA regulatory inactivator Hda  35.02 
 
 		 332 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0204  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  31.58 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2860  DnaA regulatory inactivator Hda  32.08 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2454  DnaA regulatory inactivator Hda  32.08 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1971  chromosomal replication initiator, DnaA  32.5 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2625  DnaA regulatory inactivator Hda  34.02 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2420  DnaA regulatory inactivator Hda  32.34 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>