158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3128 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  100 
 
 		 244 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  58.06 
 
 		 228 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  56.16 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  56.62 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  55.3 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  54.5 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  53.42 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  55 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  51.61 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  47.92 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  49.56 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  47.74 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  49.55 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  48.47 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  44.25 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  41.96 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  48.91 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  44.25 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  46.19 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  45 
 
 		 240 aa  178  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  44.34 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  46.54 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  46.08 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  45.66 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  48.61 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  44.29 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  44.75 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  43.84 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  45 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  37.61 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  45.05 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  46.46 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  41.36 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  43.58 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  35.27 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  37.91 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  38.63 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  33.18 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  26.6 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  26.77 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  31.8 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  26.77 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  39.46 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  28.91 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  33.91 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  31.47 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  30.77 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29.17 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  32.47 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3317  Chromosomal replication initiator DnaA  26.84 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.159079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  30.13 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.31 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3184  DNA replication initiation factor  30.77 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0673  DnaA regulatory inactivator Hda  31.25 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  30.29 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  30.4 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  32.33 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  29.78 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  27.08 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  29.81 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  26.2 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  30.63 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  28.83 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0556  DnaA regulatory inactivator Hda  33.33 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.842862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  27.89 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0929  Chromosomal replication initiator DnaA  25.54 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6289100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  26.34 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  31.47 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  26.34 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2691  DNA replication initiation factor  29.52 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.994439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2755  DNA replication initiation factor  29.52 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2864  DNA replication initiation factor  29.52 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2643  DNA replication initiation factor  29.52 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000240374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2733  DNA replication initiation factor  29.52 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  29.6 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2454  DnaA regulatory inactivator Hda  28.19 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  30.62 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2860  DnaA regulatory inactivator Hda  28.19 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  30.62 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  30.62 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02388  DNA replication initiation factor  29.05 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1173  DnaA regulatory inactivator Hda  29.05 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00363629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0747  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  26.47 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0524633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2616  DnaA regulatory inactivator Hda  29.12 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02350  hypothetical protein  29.05 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0140211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3718  DNA replication initiation factor  29.05 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2320  chromosomal replication initiator, DnaA  28 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2870  DNA replication initiation factor  29.05 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  29.05 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2643  DNA replication initiation factor  29.05 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.029874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  30.13 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778074  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2631  DNA replication initiation factor  29.05 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.127472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2779  DNA replication initiation factor  29.05 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00316092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1067  DNA replication initiation factor  28.37 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  28.7 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1078  chromosomal replication initiator protein DnaA, truncation  26.32 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.648855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3180  DnaA regulatory inactivator Hda  32 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  31.62 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  29.15 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  28.7 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>