180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3328 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3328  chromosomal replication initiator DnaA  100 
 
 		 226 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2116  hypothetical protein  49.77 
 
 		 226 aa  207  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1595  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.772855  normal  0.895156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3850  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  51.57 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.390852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3459  hypothetical protein  49.77 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2328  hypothetical protein  49.31 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2491  hypothetical protein  49.08 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2953  hypothetical protein  50.69 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2026  chromosomal replication initiator DnaA  49.31 
 
 		 252 aa  194  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.613921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0493  chromosomal replication initiator DnaA  52.65 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.947909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2340  chromosomal replication initiator DnaA  48.85 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2066  chromosomal replication initiator DnaA  48.85 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.109962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5544  Chromosomal replication initiator DnaA  48.88 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1578  hypothetical protein  49.07 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5161  chromosomal replication initiator DnaA  51.66 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0399  chromosomal replication initiator, DnaA  51.13 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2436  chromosomal replication initiator, DnaA  50.68 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192857  normal  0.0248561 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0780  hypothetical protein  50.23 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1963  hypothetical protein  46.88 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.60365  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0704  hypothetical protein  45.5 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0714  hypothetical protein  45.5 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2574  hypothetical protein  45.61 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.237947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1856  chromosomal replication initiator, DnaA  45.78 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1243  hypothetical protein  45.83 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0794  hypothetical protein  44.95 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.823382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2163  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  47.27 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1097  hypothetical protein  44.44 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682331  hitchhiker  0.0058137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3128  chromosomal replication initiator, DnaA  52.53 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1301  hypothetical protein  46.61 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0741  chromosomal replication initiator  50.67 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1298  chromosomal replication initiator DnaA  44.29 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1057  chromosomal replication initiator, DnaA  44.5 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.876262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0960  chromosomal replication initiator DnaA  43.98 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545818 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0767  hypothetical protein  36.16 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.290925  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  39.11 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0234  Chromosomal replication initiator DnaA  38.99 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2552  DnaA-related protein  39.27 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0193  chromosomal DNA replication initiator-related protein  26.61 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1146  chromosomal DNA replication initiator-related protein  27.91 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000163537  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0913  hypothetical protein  26.15 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0036  DNA replication initiation ATPase  33.17 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0901  ATPase  34.11 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1755  DNA replication initiation ATPase  32.02 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0594787  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0190  hypothetical protein  29.47 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  37.3 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.9 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  34.38 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3317  Chromosomal replication initiator DnaA  30.57 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.159079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0929  Chromosomal replication initiator DnaA  29.82 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6289100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2535  DNA replication initiation ATPase-like protein  36.45 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  35.33 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1343  DNA replication initiation factor  28.19 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000127246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  30.3 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  29.32 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  29.03 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  31.82 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  35.33 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  30.15 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3184  DNA replication initiation factor  35.33 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  30.65 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  32.84 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  30.65 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  34.78 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02244  hypothetical protein  36.55 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  34.78 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  34.78 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0747  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  28.99 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0524633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  30.65 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  32.16 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  28.22 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  28.22 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1067  DNA replication initiation factor  33.7 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2313  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  29 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0972  hypothetical protein  31.56 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0672625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02388  DNA replication initiation factor  33.16 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1173  DnaA regulatory inactivator Hda  33.16 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00363629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02350  hypothetical protein  33.16 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0140211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2779  DNA replication initiation factor  33.16 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00316092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2631  DNA replication initiation factor  33.16 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.127472  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2870  DNA replication initiation factor  33.16 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  33.16 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2643  DNA replication initiation factor  33.16 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.029874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  34.24 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3718  DNA replication initiation factor  33.16 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2984  DNA replication initiation factor  32.29 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.0618284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2775  DnaA regulatory inactivator Hda  28.38 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00936325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2320  chromosomal replication initiator, DnaA  32.75 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3519  DNA replication initiation factor  34.76 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222662  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3180  DnaA regulatory inactivator Hda  30.29 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2733  DNA replication initiation factor  32.63 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2864  DNA replication initiation factor  32.63 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2643  DNA replication initiation factor  32.63 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000240374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2691  DNA replication initiation factor  32.63 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.994439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2755  DNA replication initiation factor  32.63 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  36.41 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1717  hypothetical protein  32.71 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.308602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1412  chromosomal replication initiator, DnaA  28.99 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1078  chromosomal replication initiator protein DnaA, truncation  28.15 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.648855  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1647  hypothetical protein  32.71 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>