More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2174 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2174  Chromosomal replication initiator DnaA  100 
 
 
229 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2320  chromosomal replication initiator, DnaA  49.33 
 
 
236 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.107711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0747  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  47.9 
 
 
243 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0524633  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1078  chromosomal replication initiator protein DnaA, truncation  47.9 
 
 
258 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.648855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3317  Chromosomal replication initiator DnaA  46.96 
 
 
234 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.159079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0929  Chromosomal replication initiator DnaA  46.72 
 
 
234 aa  207  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6289100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1412  chromosomal replication initiator, DnaA  43.04 
 
 
241 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1478  Chromosomal replication initiator DnaA  33.74 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  27.67 
 
 
459 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  26.41 
 
 
443 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  28.28 
 
 
472 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  33.77 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  28.5 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2197  DnaA regulatory inactivator Hda  35.53 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2318  DnaA regulatory inactivator Hda  35.53 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1090  DnaA regulatory inactivator Hda  35.53 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3302  DnaA regulatory inactivator Hda  35.53 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0509  DnaA regulatory inactivator Hda  35.53 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.679706  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3269  DnaA regulatory inactivator Hda  35.53 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0915676  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3312  DnaA regulatory inactivator Hda  35.53 
 
 
332 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  27.57 
 
 
442 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  27.87 
 
 
468 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2912  DnaA regulatory inactivator Hda  30.47 
 
 
235 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1316  DnaA regulatory inactivator Hda  35.53 
 
 
334 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0581271  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1763  chromosomal replication initiator, DnaA  33.2 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  27.46 
 
 
468 aa  89.7  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2993  chromosomal replication initiator, DnaA  32.16 
 
 
235 aa  89  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.964957  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.57 
 
 
446 aa  88.6  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0746  DnaA regulatory inactivator Hda  29.2 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.653326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  26.72 
 
 
445 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.45 
 
 
456 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2775  DnaA regulatory inactivator Hda  30.74 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00936325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.88 
 
 
461 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  26.69 
 
 
468 aa  87  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  25.65 
 
 
440 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  26.82 
 
 
446 aa  86.3  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  28.1 
 
 
441 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  25.96 
 
 
457 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  32.03 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.670919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  25.96 
 
 
457 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0707  chromosomal replication initiator, DnaA  32.85 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  26.72 
 
 
449 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  26.92 
 
 
446 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  26.92 
 
 
446 aa  85.5  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  26.92 
 
 
446 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  26.92 
 
 
446 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  26.92 
 
 
446 aa  85.5  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  26.92 
 
 
446 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.81 
 
 
480 aa  85.1  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  26.92 
 
 
446 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  26.15 
 
 
450 aa  85.5  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  26.94 
 
 
446 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  26.94 
 
 
446 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  26.92 
 
 
446 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3953  DnaA regulatory inactivator Hda  28.76 
 
 
256 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082136 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0204  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  31.58 
 
 
205 aa  85.1  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.26 
 
 
458 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.26 
 
 
458 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.642336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  26.23 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  24.47 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  26.23 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  27.95 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  26.23 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3022  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  32.02 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.26 
 
 
457 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.65 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0001  chromosomal replication initiation protein  28.72 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  26.23 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.41 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.23 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  26.23 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  26.23 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.23 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0001  chromosomal replication initiation protein  28.72 
 
 
440 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  26.72 
 
 
460 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.18 
 
 
591 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.83 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  26.18 
 
 
587 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  26.15 
 
 
450 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  26.72 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.65 
 
 
453 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  27.13 
 
 
461 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  26.32 
 
 
462 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0001  chromosomal replication initiation protein  25.6 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.32 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  27.13 
 
 
459 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.12 
 
 
444 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  26.23 
 
 
462 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  26.23 
 
 
457 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  26.72 
 
 
462 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  26.72 
 
 
461 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  26.72 
 
 
461 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  26.72 
 
 
462 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  25.43 
 
 
443 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  26.72 
 
 
460 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  25.91 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  26.72 
 
 
460 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  25.91 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  26.72 
 
 
460 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  25.91 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>