More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2993 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2993  chromosomal replication initiator, DnaA  100 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.964957  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3564  chromosomal replication initiator, DnaA  76.65 
 
 		 228 aa  363  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.477024 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1466  DnaA regulatory inactivator Hda  66.38 
 
 		 233 aa  310  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2420  DnaA regulatory inactivator Hda  63.91 
 
 		 230 aa  307  6.999999999999999e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2993  chromosomal replication initiator, DnaA  63.91 
 
 		 230 aa  307  6.999999999999999e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.372526  normal  0.556339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1971  chromosomal replication initiator, DnaA  61.86 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2186  DnaA regulatory inactivator Hda  65.52 
 
 		 235 aa  306  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2511  chromosomal replication initiator, DnaA  63.64 
 
 		 228 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1771  chromosomal replication initiator, DnaA  62.17 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3022  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  45.33 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0746  DnaA regulatory inactivator Hda  43.35 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.653326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3953  DnaA regulatory inactivator Hda  42.92 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0673  DnaA regulatory inactivator Hda  43.11 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2489  DnaA regulatory inactivator Hda  42.49 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3269  DnaA regulatory inactivator Hda  40.17 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0915676  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2197  DnaA regulatory inactivator Hda  40.17 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2318  DnaA regulatory inactivator Hda  40.17 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0509  DnaA regulatory inactivator Hda  40.17 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.679706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1090  DnaA regulatory inactivator Hda  40.17 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3302  DnaA regulatory inactivator Hda  40.17 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3312  DnaA regulatory inactivator Hda  40.17 
 
 		 332 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1316  DnaA regulatory inactivator Hda  40.17 
 
 		 334 aa  151  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0581271  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2912  DnaA regulatory inactivator Hda  37.83 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2775  DnaA regulatory inactivator Hda  36.8 
 
 		 235 aa  141  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00936325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2625  DnaA regulatory inactivator Hda  38.75 
 
 		 315 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0222  hypothetical protein  37.17 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0660424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0679  DnaA regulatory inactivator Hda  39.5 
 
 		 318 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0276  DnaA regulatory inactivator Hda  39.66 
 
 		 261 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0654  DnaA regulatory inactivator Hda  39.5 
 
 		 318 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0760  DnaA regulatory inactivator Hda  39.66 
 
 		 261 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0204  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  36.56 
 
 		 205 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2454  DnaA regulatory inactivator Hda  37.18 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2860  DnaA regulatory inactivator Hda  37.18 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0729  DnaA regulatory inactivator Hda  40.43 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.676526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1478  Chromosomal replication initiator DnaA  36.9 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3847  DnaA regulatory inactivator Hda  39.3 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2625  DnaA regulatory inactivator Hda  37.72 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2760  DnaA regulatory inactivator Hda  36.24 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264354  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1763  chromosomal replication initiator, DnaA  34.27 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3180  DnaA regulatory inactivator Hda  34.93 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1926  DnaA-homolog protein Hda  31.9 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0267  DnaA-related protein  31.9 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2616  DnaA regulatory inactivator Hda  33.49 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1237  DNA replication initiation factor  32.03 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000322124  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1354  DNA replication initiation factor  32.03 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3125  DNA replication initiation factor  32.03 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1643  DNA replication initiation factor  31.76 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3194  hypothetical protein  32.47 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158271  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1751  DNA replication initiation factor  31.9 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2522  DnaA domain-containing protein  35.24 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1226  DNA replication initiation factor  31.65 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1668  DNA replication initiation factor  30.67 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2848  hypothetical protein  32.19 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4050  DNA replication initiation factor  30.67 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2717  hypothetical protein  31.9 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1703  DnaA family protein  31.25 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3184  DNA replication initiation factor  31.33 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.338412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3686  DNA replication initiation factor  31.25 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.504254  decreased coverage  0.00028544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1266  DNA replication initiation factor  30.25 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1132  DNA replication initiation factor  30.74 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2993  DNA replication initiation factor  32.35 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.553291  hitchhiker  0.00574523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1636  DNA replication initiation factor  30.67 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.118213  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36850  DNA replication initiation factor  33.47 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2487  chromosomal replication initiator, DnaA  30.51 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02388  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2643  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.029874  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1173  DnaA regulatory inactivator Hda  30.6 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00363629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3718  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1180  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02350  hypothetical protein  30.6 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0140211  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2870  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2779  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00316092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2631  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.127472  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2691  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.994439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2755  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2864  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2733  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.176133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2643  DNA replication initiation factor  30.6 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000240374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2989  DNA replication initiation factor  29.61 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1967  DNA replication initiation factor  31.51 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187389  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2249  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  32.17 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1067  DNA replication initiation factor  29.44 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2441  DNA replication initiation factor  31.49 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689375  normal  0.0202229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1187  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.51 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4562  DNA replication initiation factor  31.93 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52010  DNA replication initiation factor  31.93 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0929  Chromosomal replication initiator DnaA  31.06 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6289100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2499  DNA replication initiation factor  31.76 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3317  Chromosomal replication initiator DnaA  30.9 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.159079  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1786  DNA replication initiation factor  31.76 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000114863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1779  DNA replication initiation factor  31.76 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000277265  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02146  Chromosomal replication initiator, DnaA like protein to DnaA protein Hda  29.15 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1823  DNA replication initiation factor  31.76 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000711754  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1071  chromosomal replication initiator, DnaA  29.31 
 
 		 242 aa  95.1  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.163045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2164  DNA replication initiation factor  30.67 
 
 		 236 aa  95.1  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1838  DNA replication initiation factor  30.3 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0197732  normal  0.185347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1643  DNA replication initiation factor  29.6 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.135541  normal  0.709105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1576  DNA replication initiation factor  29.6 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.840172  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1651  DNA replication initiation factor  29.6 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0364353  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0518  regulatory inactivation of DnaA Hda protein  31.36 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>