More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2056 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
436 aa  893    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1853  chromosomal replication initiation protein  80.96 
 
 
436 aa  736    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  69.89 
 
 
436 aa  655    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  66.29 
 
 
441 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  61.78 
 
 
440 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  61.42 
 
 
440 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  61.42 
 
 
440 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0001  chromosomal replication initiation protein  60.78 
 
 
442 aa  535  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0001  chromosomal replication initiation protein  51.51 
 
 
435 aa  473  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.26 
 
 
437 aa  437  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.11482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  38.6 
 
 
450 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  38.83 
 
 
450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  40.14 
 
 
449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  38.18 
 
 
458 aa  319  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  39.23 
 
 
443 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  37.33 
 
 
446 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  37.78 
 
 
460 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  38.27 
 
 
445 aa  316  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  37.33 
 
 
446 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.33 
 
 
446 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  36.73 
 
 
457 aa  315  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  37.1 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  37.1 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  37.1 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  37.1 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  37.1 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  36.73 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  37.1 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.45 
 
 
591 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.45 
 
 
587 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.1 
 
 
446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.45 
 
 
528 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  39.06 
 
 
450 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  36.67 
 
 
446 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.14 
 
 
443 aa  309  6.999999999999999e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.65 
 
 
566 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  38.86 
 
 
459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  36.94 
 
 
463 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.64 
 
 
461 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.25 
 
 
480 aa  307  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.12 
 
 
453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  36.77 
 
 
465 aa  305  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  37.74 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.66 
 
 
463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  36.38 
 
 
465 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.86 
 
 
454 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  37.07 
 
 
440 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  36.04 
 
 
462 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  36.47 
 
 
441 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  36.04 
 
 
462 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.38 
 
 
462 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  39.75 
 
 
442 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.47 
 
 
474 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.33 
 
 
446 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.45 
 
 
503 aa  299  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.1 
 
 
464 aa  299  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.54 
 
 
721 aa  299  7e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.32 
 
 
474 aa  299  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  36.26 
 
 
450 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  38.53 
 
 
452 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  43.82 
 
 
443 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.7 
 
 
444 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  36.59 
 
 
467 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  36.59 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.59 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  36.59 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  36.59 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  36.59 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  36.59 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  36.59 
 
 
467 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.45 
 
 
515 aa  296  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  37.44 
 
 
466 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  37.44 
 
 
466 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  37.44 
 
 
466 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  35.79 
 
 
472 aa  296  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  37.44 
 
 
466 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 
453 aa  296  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  37.44 
 
 
466 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 
453 aa  296  6e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.3 
 
 
469 aa  296  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  37.18 
 
 
445 aa  296  7e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.07 
 
 
473 aa  295  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  36.34 
 
 
462 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.23 
 
 
468 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  35.94 
 
 
468 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  44.48 
 
 
582 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  36.36 
 
 
467 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  35.29 
 
 
461 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.36 
 
 
483 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  36.45 
 
 
451 aa  294  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.45 
 
 
451 aa  294  3e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  36.57 
 
 
450 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  35.94 
 
 
468 aa  293  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  35.68 
 
 
459 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.39 
 
 
461 aa  293  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  34.92 
 
 
460 aa  293  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  39.49 
 
 
464 aa  293  5e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  35.89 
 
 
462 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  35.89 
 
 
462 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  35.89 
 
 
462 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>