More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6288 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6288  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  100 
 
 
479 aa  957    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1462  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.2 
 
 
480 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0250838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  47.81 
 
 
468 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5856  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.04 
 
 
493 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.79 
 
 
467 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.72 
 
 
469 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60820  outer membrane protein OprJ  46.62 
 
 
479 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5238  outer membrane protein OprM  46.75 
 
 
475 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.33 
 
 
475 aa  320  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.27 
 
 
486 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  40.6 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  40.6 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  38.84 
 
 
486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.53 
 
 
486 aa  306  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.28 
 
 
484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.53 
 
 
469 aa  301  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.28 
 
 
484 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.28 
 
 
484 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.88 
 
 
477 aa  299  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.07 
 
 
484 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.7 
 
 
474 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.34 
 
 
544 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1891  outer membrane efflux protein OprA  40.68 
 
 
513 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.271004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  40.68 
 
 
516 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1660  hypothetical protein  40.68 
 
 
516 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.077421  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.68 
 
 
496 aa  296  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  40.68 
 
 
513 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  42.26 
 
 
467 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.32 
 
 
480 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.96 
 
 
495 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.4 
 
 
476 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.91 
 
 
501 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.039626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.35 
 
 
485 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.06 
 
 
478 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.72 
 
 
476 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.72 
 
 
476 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.72 
 
 
476 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  38.83 
 
 
491 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.92 
 
 
516 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.49 
 
 
480 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0403  outer membrane protein OprM  37.8 
 
 
485 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0389  outer membrane protein OprM  38.02 
 
 
485 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303382  hitchhiker  0.0000297498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.78 
 
 
482 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  39.62 
 
 
469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0381  outer membrane protein OprM  37.8 
 
 
485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119096 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.21 
 
 
500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.36 
 
 
474 aa  287  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  38.33 
 
 
460 aa  287  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0443  outer membrane efflux protein OprA  37.8 
 
 
485 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.340499  hitchhiker  0.0000000156404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.58 
 
 
472 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.79 
 
 
477 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  38.55 
 
 
499 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0383  outer membrane protein OprM  37.8 
 
 
485 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1614  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.43 
 
 
487 aa  286  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0245631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.39 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.55 
 
 
514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  37.95 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.48 
 
 
507 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.77 
 
 
514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.97 
 
 
507 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.21 
 
 
485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.08 
 
 
489 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.59 
 
 
507 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.89 
 
 
517 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  37.9 
 
 
460 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.14 
 
 
472 aa  282  9e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.69 
 
 
485 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1337  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.31 
 
 
471 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.69 
 
 
461 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.55 
 
 
470 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.2 
 
 
501 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 
507 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.45 
 
 
510 aa  281  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.39 
 
 
507 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2327  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.45 
 
 
528 aa  280  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.356993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.15 
 
 
483 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.02 
 
 
486 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.02 
 
 
486 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.39 
 
 
492 aa  279  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0311  outer membrane CHANEL lipoprotein  41.48 
 
 
476 aa  279  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.564157  normal  0.11877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2838  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.59 
 
 
528 aa  279  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.207275 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.09 
 
 
507 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.09 
 
 
507 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  37.8 
 
 
457 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  37.8 
 
 
457 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.8 
 
 
457 aa  277  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.3 
 
 
503 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.43 
 
 
508 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229467  normal  0.0582449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.19 
 
 
499 aa  277  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  37.8 
 
 
457 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  37.8 
 
 
457 aa  276  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.08 
 
 
483 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.9 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6206  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.93 
 
 
508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238233 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5839  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.93 
 
 
508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  36.64 
 
 
512 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.42 
 
 
470 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.38 
 
 
489 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  36.84 
 
 
474 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.52 
 
 
505 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>