53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4230 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  48.72 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  44.15 
 
 		 268 aa  141  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  41.21 
 
 		 206 aa  130  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  38.62 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  36.41 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  39.66 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  42.33 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  40 
 
 		 218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  37.7 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  30.41 
 
 		 216 aa  91.7  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  30.69 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  36.11 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  36.63 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  38.19 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  32.04 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  36.07 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  34.04 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  33.83 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  27.07 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  27.23 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  31.97 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  25.38 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  27.72 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  32.28 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  27.75 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  28.87 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  29.73 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  29.41 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  29.57 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  29.57 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  27.47 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  31.73 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  28.85 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  32.35 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0171  protein of unknown function DUF1211  40.16 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.802935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  30.77 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  26.78 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3101  protein of unknown function DUF1211  26.98 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0756  integral membrane protein-like  26.21 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0559013  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2044  hypothetical protein  30.58 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00130597  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2702  hypothetical protein  28.96 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291877  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2666  hypothetical protein  29.25 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.768262  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  27.47 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3585  protein of unknown function DUF1211  28.33 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.675364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0312  hypothetical protein  33.64 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.904588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  30 
 
 		 334 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  25.49 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  26.2 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3064  transglutaminase-like  27.98 
 
 		 269 aa  42  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>