47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2545 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  64.71 
 
 		 194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  62.83 
 
 		 191 aa  231  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  59.14 
 
 		 194 aa  228  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  59.26 
 
 		 191 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  54.01 
 
 		 193 aa  217  8.999999999999998e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  62.96 
 
 		 191 aa  207  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  61.9 
 
 		 191 aa  204  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  57.14 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  54.87 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  57.22 
 
 		 190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  57.3 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  43.59 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  58.38 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  32.98 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  38.46 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  34.78 
 
 		 195 aa  94.7  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  40.48 
 
 		 205 aa  84.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  36.89 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  30.48 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  38 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  36.54 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  29.2 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  29.57 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  37.89 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  34.78 
 
 		 334 aa  62  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  33.33 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  35 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  27.75 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  29.08 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  38.71 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  30.7 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  31.01 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  29.6 
 
 		 239 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  29.66 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  27.45 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  26.02 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  29.67 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  29.6 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  41.79 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  31.91 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2044  hypothetical protein  29.59 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00130597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  30.61 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0938  integral membrane protein  31.02 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000154072  normal  0.402272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  24.24 
 
 		 204 aa  42  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  25.61 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>