31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1506 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  32.86 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  30.94 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  29.25 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  29.19 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  29.85 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  37.89 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  37.89 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  28.86 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  27.89 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  28.4 
 
 
191 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  28.99 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  32.61 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  36.04 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  33.01 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  34.75 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  25.56 
 
 
295 aa  51.6  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  32.04 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  27.87 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  30.17 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  32.04 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  23.12 
 
 
199 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  26.45 
 
 
206 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  34.43 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  24.26 
 
 
199 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  31.78 
 
 
208 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  34.45 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  27.16 
 
 
268 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  32.81 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  30 
 
 
212 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>