52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1196 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  408  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  57.98 
 
 
191 aa  221  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  57.53 
 
 
194 aa  217  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  53.76 
 
 
193 aa  216  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  59.14 
 
 
190 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  54.3 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  56.99 
 
 
191 aa  207  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  58.12 
 
 
191 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  57.37 
 
 
191 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  57.14 
 
 
193 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  57.14 
 
 
193 aa  203  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  60.22 
 
 
190 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  53.89 
 
 
203 aa  191  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  60.22 
 
 
190 aa  187  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  42.71 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  35.6 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  43.1 
 
 
199 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  33.53 
 
 
195 aa  105  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  33.52 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  32.67 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  39.8 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  37.25 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  30.12 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  26.82 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  29.78 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  30.95 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  34.19 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  29.25 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  30.29 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  30.93 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  24.16 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  27.72 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  37.37 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  28.65 
 
 
295 aa  58.2  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  34.17 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  27.03 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  27.51 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  27.56 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  31.78 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  28.97 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  27.78 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  29.57 
 
 
201 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  30.98 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  25.71 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2044  hypothetical protein  31.46 
 
 
197 aa  45.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00130597  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3585  protein of unknown function DUF1211  29.91 
 
 
251 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.675364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  28.23 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  35.64 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0938  integral membrane protein  26.87 
 
 
227 aa  42  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000154072  normal  0.402272 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0312  hypothetical protein  25.81 
 
 
234 aa  41.2  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.904588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>