27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0140 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  32.21 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  31.76 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  28.7 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  28.97 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  27.03 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  28.03 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  27.03 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  27.03 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  26.67 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  26.72 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  26.37 
 
 		 199 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  30 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  27.78 
 
 		 215 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  25.15 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  24.5 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  29.67 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  29.67 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  25.17 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  30.3 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  30.49 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  25.49 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  32.31 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  28.75 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  29.23 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  21.43 
 
 		 218 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  31.65 
 
 		 211 aa  40.8  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>