44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6231 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  39.09 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  30.73 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  32.93 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  44.55 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  30 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  30.94 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  29.95 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  28.19 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  25.89 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  31.47 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  29.44 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  31.49 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  34.12 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  28.26 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  32.12 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  29.78 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  30.81 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  31.18 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  34.4 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  29.1 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  36.89 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  35 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  27.59 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  33.64 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  29.06 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  29.55 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  35 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  35 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  27.36 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  36.27 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  30.1 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  33.33 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  29.31 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  24.18 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  29.48 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  35.96 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  35.09 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  30.3 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  31.78 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  29.74 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3585  protein of unknown function DUF1211  25.7 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.675364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  30.49 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>