48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4865 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  100 
 
 
206 aa  408  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  45.1 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  41 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  38.34 
 
 
268 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  94  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  49.09 
 
 
212 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  37.7 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  33.12 
 
 
239 aa  84.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  36.96 
 
 
205 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  32.68 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  34.12 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  33.33 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  36.45 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  33.52 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  34.19 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  28.72 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  32.34 
 
 
194 aa  72  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0171  protein of unknown function DUF1211  37.61 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.802935  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  38.71 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  38.71 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  28.72 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  31.79 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3585  protein of unknown function DUF1211  29.8 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.675364  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  30.2 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  37.7 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  31.78 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  37.25 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  38.14 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  30.67 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  26.96 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  35.14 
 
 
194 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  37.28 
 
 
210 aa  62  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  31.87 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  27.59 
 
 
295 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  33.65 
 
 
219 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  32.41 
 
 
191 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  31.21 
 
 
191 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  28.5 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  29.9 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  29.86 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  28.1 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  24.28 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  34.94 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  28 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  25.75 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0756  integral membrane protein-like  21.48 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0559013  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  26 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3101  protein of unknown function DUF1211  26.87 
 
 
190 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>