51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0541 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  42.42 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  48.36 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  30.73 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  37.33 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  36.92 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  40.48 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  33.15 
 
 		 239 aa  87.8  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  31.55 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  33.52 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  40.48 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  40.48 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  37.4 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  41.09 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  32.09 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  41.27 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  40.48 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  29.77 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  32.81 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  30.95 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  37.04 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  39.09 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  36.96 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  37.13 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  31.5 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  40.31 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  30.19 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  37.62 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  35.21 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  32.32 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  37.82 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  45.83 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  33.68 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  28.08 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  30.5 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  33.51 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  26.32 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  25.29 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  29 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  28.57 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  27.87 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3101  protein of unknown function DUF1211  28.47 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642215  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0171  protein of unknown function DUF1211  31.88 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.802935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  29.67 
 
 		 334 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  29 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  28.9 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  30.3 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2702  hypothetical protein  26.72 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291877  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0776  hypothetical protein  24.69 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.668406  normal  0.352446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>