44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2037 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  36.5 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  37.62 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  36.87 
 
 		 295 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  31.31 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  35.76 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  27.22 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  27.07 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  30.81 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  31.33 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  28 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  33.58 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  30.85 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  27.42 
 
 		 268 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  25.29 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  34.75 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  29.73 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  27.22 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  28.71 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  28.26 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  23.65 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  25.28 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  29.29 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  27.1 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  28.28 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0756  integral membrane protein-like  25.14 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0559013  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  27.78 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  25.96 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  27.27 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  25.79 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0776  hypothetical protein  21.79 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.668406  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  28.1 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  28.57 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  26.8 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  24 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  25.74 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3585  protein of unknown function DUF1211  30.33 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.675364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  28.1 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0775  hypothetical protein  25.82 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176297  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  28.75 
 
 		 172 aa  42.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  32.79 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  24.24 
 
 		 193 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  24.24 
 
 		 193 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  22.43 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>