47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1340 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  65.45 
 
 
194 aa  254  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  65.59 
 
 
191 aa  250  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  63.98 
 
 
194 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  66.67 
 
 
191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  65.61 
 
 
191 aa  235  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  62.83 
 
 
193 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  62.83 
 
 
193 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  59.38 
 
 
203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  58.82 
 
 
190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  53.23 
 
 
193 aa  208  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  56.99 
 
 
205 aa  207  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  47.89 
 
 
199 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  58.82 
 
 
190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  59.89 
 
 
190 aa  188  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  41.79 
 
 
199 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  32.45 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  42.02 
 
 
195 aa  101  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  31.55 
 
 
205 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  30.06 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  36.89 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  39 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  40.82 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  35 
 
 
208 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  34.95 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  30.65 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  31.73 
 
 
202 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  31.47 
 
 
334 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  27.66 
 
 
218 aa  62.8  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  31.97 
 
 
295 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  31.78 
 
 
216 aa  61.6  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  28.99 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  35.09 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  26.2 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  37.7 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  26.67 
 
 
172 aa  54.7  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  24.86 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  29.29 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  33 
 
 
239 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  27.49 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  30.93 
 
 
215 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  32.67 
 
 
229 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  29.41 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2044  hypothetical protein  26.23 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00130597  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0938  integral membrane protein  30 
 
 
227 aa  42.4  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000154072  normal  0.402272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>