19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0938 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0938  integral membrane protein  100 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000154072  normal  0.402272 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  31.28 
 
 		 334 aa  98.2  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  28.16 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  27.37 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0312  hypothetical protein  27.81 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.904588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  25.13 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  31.02 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  31.02 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  27.27 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  25.53 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  26.84 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  33.04 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  26.09 
 
 		 191 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  27.78 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  26.09 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  24.1 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  28.83 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0714  integral membrane protein  62.07 
 
 		 175 aa  42.7  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.244509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>