48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0471 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  59.38 
 
 
191 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  56.25 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  56.08 
 
 
194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  55.28 
 
 
191 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  54.87 
 
 
193 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  54.87 
 
 
193 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  50.79 
 
 
193 aa  197  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  53.89 
 
 
205 aa  191  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  55.26 
 
 
190 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  44.1 
 
 
199 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  53.06 
 
 
191 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  52.53 
 
 
191 aa  175  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  57.37 
 
 
190 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  57.37 
 
 
190 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  34.18 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  37.04 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  36.3 
 
 
195 aa  94.7  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  37.4 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  36.45 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  32.68 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  41.24 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  29.29 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  42.86 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  28.86 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  27.03 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  33.64 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  27.41 
 
 
218 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  34.65 
 
 
268 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  26.06 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  32.43 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  28.91 
 
 
334 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  28 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  30 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  39.36 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2044  hypothetical protein  32.67 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00130597  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  27.88 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  29.13 
 
 
295 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  27.34 
 
 
215 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  30.48 
 
 
216 aa  51.6  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  35.71 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  25.96 
 
 
204 aa  48.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  29.23 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  24 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  26.36 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3585  protein of unknown function DUF1211  31.31 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.675364  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  42.65 
 
 
210 aa  41.2  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>