23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0746 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  449  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  33.17 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  36.36 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  25.25 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  29.37 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  26.57 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  35 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  28.47 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  29.2 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  29.2 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  24.16 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  27.66 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  26.06 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  31.58 
 
 
190 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  30.1 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  32.63 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  31.63 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  29.47 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  31.58 
 
 
190 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  32.97 
 
 
334 aa  48.9  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  32.81 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  24.72 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>