50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0932 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  371  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  35.6 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  36.7 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  35.14 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  34.18 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  34.21 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  36.13 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  32.8 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  34.55 
 
 		 191 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  32.45 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  32.45 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  33.51 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  32.09 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  32.98 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  32.98 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  29.23 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  34.05 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  35.71 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  31.76 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  35.77 
 
 		 334 aa  74.7  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  25.25 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  29.61 
 
 		 220 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  28 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  28.26 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  32.65 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  34.58 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  33.68 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  40.21 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  30.93 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  24.16 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  28.8 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  36.04 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  26.62 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  29.31 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  29.86 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  32.5 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  25.29 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0312  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  51.2  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.904588  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0938  integral membrane protein  28.57 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000154072  normal  0.402272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  27.47 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  32 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  26 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  28.16 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  36 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0713  integral membrane protein  51.92 
 
 		 60 aa  46.2  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0920393  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  27.36 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  26.13 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2044  hypothetical protein  29.35 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00130597  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0171  protein of unknown function DUF1211  29.55 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.802935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  25.56 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>